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Enregistrement W4200541078 · doi:10.1117/1.jbo.26.12.126501

Low-cost optofluidic add-on enables rapid selective plane illumination microscopy of C. elegans with a conventional wide-field microscope

2021· article· en· W4200541078 sur OpenAlexafffund

Notice bibliographique

RevueJournal of Biomedical Optics · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced Fluorescence Microscopy Techniques
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCMC Microsystems
Mots-clésFluorescence microscopeMicroscopyMicroscopeOptical microscopeMicrofluidicsFluorescence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SIGNIFICANCE: Selective plane illumination microscopy (SPIM) is an emerging fluorescent imaging technique suitable for noninvasive volumetric imaging of C. elegans. These promising microscopy systems, however, are scarce in academic and research institutions due to their high cost and technical complexities. Simple and low-cost solutions that enable conversion of commonplace wide-field microscopes to rapid SPIM platforms promote widespread adoption of SPIM by biologist for studying neuronal expressions of C. elegans. AIM: We sought to develop a simple and low-cost optofluidic add-on device that enables rapid and immobilization-free volumetric SPIM imaging of C. elegans with conventional fluorescent microscopes. APPROACH: A polydimethylsiloxane (PDMS)-based device with integrated optical and fluidic elements was developed as a low-cost and miniaturized SPIM add-on for the conventional wide-field microscope. The developed optofluidic chip contained an integrated PDMS cylindrical lens for on-chip generation of the light-sheet across a microchannel. Cross-sectional SPIM images of C. elegans were continuously acquired by the native objective of microscope as worms flowed in an L-shape microchannel and through the light sheet. RESULTS: On-chip SPIM imaging of C. elegans strains demonstrated possibility of visualizing the entire neuronal system in few seconds at single-neuron resolution, with high contrast and without worm immobilization. Volumetric visualization of neuronal system from the acquired cross-sectional two-dimensional images is also demonstrated, enabling the standard microscope to acquire three-dimensional fluorescent images of C. elegans. The full-width at half-maximum width of the point spread function was measured as 1.1 and 2.4 μm in the lateral and axial directions, respectively. CONCLUSION: The developed low-cost optofluidic device is capable of continuous SPIM imaging of C. elegans model organism with a conventional fluorescent microscope, at high speed, and with single neuron resolution.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,155
Score d'incertitude au seuil0,650

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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