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Enregistrement W4200574458 · doi:10.1101/2021.12.14.472730

Animal soil food web complexity triggers shifts in microbial communities, including PAH degraders, but without clear effects on phenanthrene phytoremediation

2021· preprint· en· W4200574458 sur OpenAlexaff
Sara Correa‐García, Vincenzo Corelli, Julien Tremblay, Jessica Dozois, Eugenie Mukula, Armand Séguin, Étienne Yergeau

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSoil Carbon and Nitrogen Dynamics
Établissements canadiensNational Research Council CanadaUniversité du QuébecInstitut National de la Recherche ScientifiqueNatural Resources Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhytoremediationPhenanthreneMicrobial population biologyWillowEcosystemSoil food webBiomass (ecology)Soil microbiologyFood webEnvironmental chemistryBiologyEnvironmental scienceEcologyContaminationChemistrySoil waterBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The aim of this study was to determine whether the complexity of the animal soil food web (SFWC) is a significant factor influencing the soil microbial communities, the productivity of the willow, and the degradation rates of 100 mg kg -1 phenanthrene contamination. The SFWC treatment had eight levels: just the microbial community (BF), or the BF with nematodes (N), springtails (C), earthworms (E), CE, CN, EN, CEN. After eight weeks of growth, the height and biomass of willows were significantly affected by the SFWC, whereas the amount of phenanthrene degraded was not affected, reaching over 95% in all pots. SFWC affected the structure and the composition of the bacterial, archaeal and fungal communities, with significant effects of SFWC on the relative abundance of fungal genera such as Sphaerosporella , a known willow symbiont during phytoremediation, and bacterial phyla such as Actinobacteriota , containing many PAH degraders. These SFWC effects on microbial communities were not clearly reflected in the community structure and abundance of PAH degraders, even though some degraders related to the Actinobacteriota and the diversity of Gram-negative degraders were affected by the SFWC treatments. Overall, our results suggest that, under our experimental conditions, SFWC does not affect significantly willow phytoremediation outcomes. Importance Polycyclic aromatic hydrocarbons (PAH) pose a threat to soil ecosystems. Phytoremediation is a green technology that can help restore ecosystems’ health affected by PAH contamination. Past research on phytoremediation of PAH has focused on the roles of plant and microbes in contaminant fates. However, soil environments usually harbor large faunal communities that interact with both the plant and the microbial communities, potentially altering the phytoremediation process. We hypothesized that soil food web complexity (SFWC), represented by increasing levels of soil fauna, influences PAH degradation through interactions with the plant and the microbes. In this study, we demonstrated that SFWC increases the plant biomass and changes the composition of the microbial community, especially the fungal structure. In our pot experiment, more complex levels of SFWC did not contribute to higher degradation rates, but the increased plant biomass and the higher relative abundance of fungal genera associated with lower plant stress could indirectly contribute to better phytoremediation outcomes. Our results highlight the importance of considering the contributions of soil fauna to the success of phytoremediation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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