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Enregistrement W4205102900 · doi:10.1158/1538-7755.disp21-po-099

Abstract PO-099: African American women with breast cancer have unique molecular features and reduced clinical trial enrollment

2022· article· en· W4205102900 sur OpenAlexaff
Genevra Magliocco, Roy Khalifé, Anthony Magliocco

Notice bibliographique

RevueCancer Epidemiology Biomarkers & Prevention · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBreast Cancer Treatment Studies
Établissements canadiensNational Research Council Institute for Biodiagnostics
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineIncidence (geometry)Breast cancerInternal medicineEtiologyEpidemiologyClinical trialOncologyCancerDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Introduction: African American (AA) women have a lower incidence of breast cancer (BC), however experience higher rates of more aggressive subtypes, mortality, and worse outcomes compared to Caucasian (C) women. Data also points to disparities among treatment access and response in AA women. Most existing genetic research and clinical trials have been conducted with majority C women, thus our existing knowledge about molecular profiles and effective treatments may not be accurate for AA women. The aim of this study is to uncover the biological and social factors related to treatment that may be causing this disparity in BC outcomes between AA and C women. Materials and Methods: Data from Surveillance, Epidemiology, and End Results (SEER) and The Cancer Genome Atlas Program (TCGA) was analyzed for differences in etiology, incidence, and prevalence of BC between AA and C. Prevalence of molecular aberrations and subtypes of BC were assessed to gain insight into potential causes of this disparity. FDA's Drug Trials Snapshots data was assessed for clinical trial enrollment by race. Results: SEER data from 2000-2018 reveals AA patients have higher incidences of TNBC and HER2 enriched BC compared to C, with luminal A incidence being higher in C patients. Within all subtypes of BC, 5-year survival rates were significantly lower for AA compared to C. TCGA data found 2282 genes that were significantly differentially altered in C vs. AA subgroups. Among the most commonly altered and significantly different genes, CSMD1 and TP53 were more prevalent among AA (19.78% AA vs. 10.79% in C for CSMD1, and 40.09% AA vs. 28.58% C for TP53), and PIK3CA among C (36.28% (C) vs. 22.47% (AA)). Survival analysis revealed AA women with PIK3CA alterations had lower rates of disease-free survival compared to C women. Clinical trials for oncology drugs approved in 2020 enrolled 5% AAs, with AAs also being underrepresented for BC specific drugs. The recent NCT02492711 trial of MARGENZA, for metastatic HER2 positive BC, had 5% AA compared to 80% C, the NCT01631552 trial of TRODELVY, for metastatic triple negative BC (TNBC), had 7% AA vs. 76% C, and the NCT02614794 trial of TUKYSA, for advanced HER2+ BC, had 9% AA vs. 73% C. Conclusion: Most existing treatments are for luminal A BC; with fewer approved drugs for subtypes more common among AA women, including the more aggressive TNBC. Recent data indicates that AA women continue to be underrepresented in clinical trials, despite having higher incidence of both HER2 and TNBC, resulting in a poor understanding of effective treatment for this subgroup. These factors may perpetuate disparities in outcomes for AA women with BC. Additionally, TCGA data uncovered underlying molecular differences in BC between AA and C women, some that are actionable. Disparities are multifactorial and can include both biological and socioeconomic factors. Thus, as we move towards more personalized medicine, it is increasingly important to improve representation of AA women in precision oncology trials. Citation Format: Genevra Magliocco, Roy Khalife, Anthony Magliocco. African American women with breast cancer have unique molecular features and reduced clinical trial enrollment [abstract]. In: Proceedings of the AACR Virtual Conference: 14th AACR Conference on the Science of Cancer Health Disparities in Racial/Ethnic Minorities and the Medically Underserved; 2021 Oct 6-8. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Epidemiol Biomarkers Prev 2022;31(1 Suppl):Abstract nr PO-099.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,041

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0120,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,370
Écart entre enseignants0,340 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
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