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Enregistrement W4205138922 · doi:10.1002/tax.12649

Global phylogeny and taxonomic reassessment of the lichen genus<i>Dendriscosticta</i>(Ascomycota: Peltigerales)

2021· article· en· W4205138922 sur OpenAlexaff
Antoine Simon, Bernard Goffinet, Li‐Song Wang, Toby Spribille, Trevor Goward, Т. Н. Пыстина, Natalia V. Semenova, Н. В. Степанов, Bibiana Moncada, Robert Lücking, Nicolas Magain, Emmanuël Sérusiaux

Notice bibliographique

RevueTaxon · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLichen and fungal ecology
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaRoyal British Columbia MuseumUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesDivision of Environmental BiologyUral Branch, Russian Academy of SciencesFonds pour la Formation à la Recherche dans l’Industrie et dans l’AgricultureFonds De La Recherche Scientifique - FNRSNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBiologyLichenCladeGenusAscomycotaPhylogeneticsPhylogenetic treeZoologyMolecular phylogeneticsSystematicsTaxonomy (biology)TaxonBotanyEvolutionary biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The genusDendriscosticta(Ascomycota: Peltigerales) encompasses several distinctive lichen‐forming fungal species restricted to the Northern Hemisphere. Most are flagship species of old‐growth forests with good air quality. A global phylogeny of the genus based on multilocus sequence data (ITS,RPB1,EF‐1α,MCM7), model‐based phylogenetic methods, and morphological and chemical assessments, reveals a high level of cryptic speciation often associated with restricted geographical distribution and/or chemical characters. Using sequence‐based species delimitation approaches, we circumscribe two main clades referred to as theD. wrightiiclade, with five unequivocal species, includingD. gelidasp. nov., and theD. praetextataclade, with eight putative species, includingD. phyllidiatasp. nov. The absence of recently collected material ofD. hookericomb. nov. from the type locality unfortunately prevents assignment of this epithet to one of the five supported lineages sharing this morphotype. Three new combinations are proposed:D. hookeri,D. insinuanscomb. nov. andD. yatabeanacomb. nov. Epitypes are designated forD. wrightiiandD. yatabeana. Species diversity within the genus increased from four to nine. Our morphological assessment confirmed thatStictaandDendriscostictacan be readily distinguished by the presence of excipular algae whereas the structure of the lower surface pores is not a reliable diagnostic feature.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,206
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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