The prevalence of <i>Cyclospora cayetanensis</i> in water: a systematic review and meta-analysis
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Cyclospora cayetanensis is an emerging food- and waterborne pathogen that causes cyclosporiasis, a gastrointestinal disease in humans. The parasite is endemic in tropical and subtropical regions; however, its prevalence is largely dependent on environmental factors, such as climate and rainfall patterns. The objective of this paper was to conduct a systematic review and meta-analysis to determine the prevalence of C. cayetanensis in water and to determine if geography, water source and other variables influence this prevalence. A literature search was performed using search terms relating to water and C. cayetanensis in MEDLINE ® , CAB Direct, Food Science and Technology Abstracts, Agricola databases and Environmental Science Index. Observational studies published in English after 1979 were eligible. Screening, data extraction and risk-of-bias assessment were performed independently by two reviewers. A multi-level random-effects meta-analysis was completed to determine the prevalence of C. cayetanensis in water and subgroup meta-analyses were performed to explore between-study heterogeneity. The search identified 828 unique articles, and after the screening, 33 articles were included in the review. The pooled prevalence of C. cayetanensis in water was 6.90% [95% confidence interval (CI) 2.25%–13.05%, I 2 = 84.38%]. Subgroup meta-analyses revealed significant differences in the prevalence between continents. Additionally, laboratory methods between studies were highly variable and these findings highlight the need for further environmental research on C. cayetanensis in water using detection methods that include PCR and sequencing to accurately identify the organism. The results of this study can be used to help assess the risk of waterborne cyclosporiasis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,005 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,007 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».