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Enregistrement W4205142349 · doi:10.22215/etd/2021-14670

Regulation of Citric Acid Cycle Enzymes and Related Pathways in the Skeletal Muscle of Hibernating Richardson’s Ground Squirrels, Urocitellus Richardsonii

2021· dissertation· en· W4205142349 sur OpenAlexaboutno aff
Stuart Green

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typedissertation
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdipose Tissue and Metabolism
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHibernation (computing)Citric acid cycleSkeletal muscleBiochemistryBiologyPyruvate dehydrogenase complexPhosphorylationTorporEnzymeDehydrogenaseGlycolysisCitrate synthaseInternal medicineChemistryEndocrinologyThermoregulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Richardson's ground squirrels (Urocitellus richardsonii) are small rodents inhabiting western Canada that spend a large portion of their life in hibernation. Hibernation is accompanied by a profound drop in body temperature to a minimum of 2-3 °C and a notable shift from carbohydrate to lipid consumption that involves large-scale rearrangements of central metabolic processes. This thesis investigated the regulation of key enzymatic checkpoints in the citric acid cycle (CAC) as well as enzymes that shuttle substrates into the CAC in skeletal muscle of ground squirrels during hibernation. Initial work investigated regulation of the pyruvate dehydrogenase complex (PDC) that bridges glycolysis and the CAC. Muscle PDC showed few changes in properties in terms of activity and inhibitory phosphorylation of the enzyme. This was in stark contrast to liver where strong suppression of PDC activity occurred during hibernation correlated with increased inhibitory phosphorylation on serine-300. This then led to investigation of two crucial irreversible regulatory steps of the CAC in the muscle: citrate synthase (CS) and the α-ketoglutarate dehydrogenase complex (KGDC). CS activity decreased significantly during hibernation. This correlated with decreased lysine succinylation of CS that reflected increased SIRT5 levels, the enzyme responsible for desuccinylase activity in mitochondria. KGDC also showed decreased affinity for coenzyme A in hibernating squirrels and marked differences in posttranslational modifications including increased tyrosine phosphorylation on all three enzyme subunits and increased serine phosphorylation on E2 subunit. Stimulating the action of endogenous protein kinases demonstrated decreased affinity for coenzyme A. Finally, regulation of muscle glutamate dehydrogenase (GDH) was analyzed to ascertain how GDH regulation mediated the flow of α-ketoglutarate into the CAC from amino acid catabolism. Most GDH kinetic parameters were unaffected between hibernating and euthermic states, except that glutamate affinity was substantially lower at 8 °C (a physiologically relevant temperature) for the enzyme from hibernating squirrels. GDH from hibernating animals also exhibited significantly higher ADP-ribosylation, suggesting a regulatory mechanism for modulating GDH. Taken together these findings suggest that enzymatic regulation in Richardson's ground squirrel muscle is actively mediated by a variety of posttranslational mechanisms of the CAC and related enzymes to coordinate metabolic suppression during hibernation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
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