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Enregistrement W4205165767 · doi:10.3410/f.717968309.793468024

Faculty Opinions recommendation of Residual body removal during spermatogenesis in C. elegans requires genes that mediate cell corpse clearance.

2012· dataset· en· W4205165767 sur OpenAlexaff
W. Brent Derry, Benjamin Lant

Notice bibliographique

RevueFaculty Opinions – Post-Publication Peer Review of the Biomedical Literature · 2012
Typedataset
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCell biologyBiologyCaenorhabditis elegansSpermatogenesisGeneCellPhagocytosisGeneticsEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Generation of spermatozoa involves segregation of most of the cytoplasm into residual bodies, which are detached from spermatids and eliminated in mammals. However, the molecular and cellular mechanism underlying the removal of residual bodies remains largely unknown. Here, we demonstrate that during C. elegans spermatogenesis residual bodies are engulfed and degraded by gonadal sheath cells, a process that uses the same set of genes underlying apoptotic cell removal. The two partially redundant engulfment pathways that clear cell corpses also mediate phagocytosis of residual bodies, possibly by recognizing the 'eat me' signal phosphatidylserine exposed on the surface. The residual body-containing phagosome undergoes a maturation process involving sequential steps including dynamic coating with PtdIns(3)P and association of RAB small GTPases. The genetic hierarchy of residual body removal in hermaphrodites is similar to that of cell corpse clearance, but male residual body removal involves a distinct hierarchy, with differential use of the engulfment genes. Efficient removal of residual bodies regulates the number of spermatids and effective transfer of spermatids during male matings. Our results indicate that a similar molecular mechanism is employed for the removal of residual bodies and apoptotic cell corpses in C. elegans. PMID: 23172915

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,038
Score d'incertitude au seuil0,126

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0040,006
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0380,021

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,310
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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