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Enregistrement W4205196630 · doi:10.1186/s12880-021-00729-7

Deep learning-based pancreas volume assessment in individuals with type 1 diabetes

2022· article· en· W4205196630 sur OpenAlexfundno aff
Raphael Roger, Melissa A. Hilmes, Jonathan M. Williams, Daniel J. Moore, Alvin C. Powers, R. Cameron Craddock, John Virostko

Notice bibliographique

RevueBMC Medical Imaging · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatitis Pathology and Treatment
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesJuvenile Diabetes Research Foundation CanadaJuvenile Diabetes Research Foundation International
Mots-clésPancreasMagnetic resonance imagingMedicineDiabetes mellitusVolume (thermodynamics)Convolutional neural networkType 2 diabetesArtificial intelligenceComputer scienceRadiologyNuclear medicineInternal medicineEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Pancreas volume is reduced in individuals with diabetes and in autoantibody positive individuals at high risk for developing type 1 diabetes (T1D). Studies investigating pancreas volume are underway to assess pancreas volume in large clinical databases and studies, but manual pancreas annotation is time-consuming and subjective, preventing extension to large studies and databases. This study develops deep learning for automated pancreas volume measurement in individuals with diabetes. A convolutional neural network was trained using manual pancreas annotation on 160 abdominal magnetic resonance imaging (MRI) scans from individuals with T1D, controls, or a combination thereof. Models trained using each cohort were then tested on scans of 25 individuals with T1D. Deep learning and manual segmentations of the pancreas displayed high overlap (Dice coefficient = 0.81) and excellent correlation of pancreas volume measurements (R2 = 0.94). Correlation was highest when training data included individuals both with and without T1D. The pancreas of individuals with T1D can be automatically segmented to measure pancreas volume. This algorithm can be applied to large imaging datasets to quantify the spectrum of human pancreas volume.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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