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Enregistrement W4205249103 · doi:10.34133/2022/9783128

Automated Segmentation and Connectivity Analysis for Normal Pressure Hydrocephalus

2022· article· en· W4205249103 sur OpenAlexfundno aff
Angela Zhang, Amil Khan, Saisidharth Majeti, Judy Pham, Christopher Nguyen, Peter Tran, Vikram Iyer, Ashutosh Shelat, Jefferson W. Chen, B.S. Manjunath

Notice bibliographique

RevueBME Frontiers · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueCerebrospinal fluid and hydrocephalus
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesJanssen Alzheimer Immunotherapy Research And DevelopmentNational Institute on AgingNational Institutes of HealthGenentechIXICOH. Lundbeck A/SServierEisaiNorthern California Institute for Research and EducationAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeGE HealthcarePfizerBiogenBioClinicaF. Hoffmann-La RocheUniversity of Southern CaliforniaNovartis Pharmaceuticals CorporationU.S. Department of DefenseEli Lilly and CompanyBristol-Myers SquibbFoundation for the National Institutes of HealthMeso Scale DiagnosticsAlzheimer's AssociationNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchNational Science Foundation
Mots-clésComputer scienceNormal pressure hydrocephalusSegmentationArtificial intelligenceConnectomicsHausdorff distancePattern recognition (psychology)Diffusion MRIThird ventricleMagnetic resonance imagingConnectomeRadiologyMedicineNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective and Impact Statement . We propose an automated method of predicting Normal Pressure Hydrocephalus (NPH) from CT scans. A deep convolutional network segments regions of interest from the scans. These regions are then combined with MRI information to predict NPH. To our knowledge, this is the first method which automatically predicts NPH from CT scans and incorporates diffusion tractography information for prediction. Introduction . Due to their low cost and high versatility, CT scans are often used in NPH diagnosis. No well-defined and effective protocol currently exists for analysis of CT scans for NPH. Evans’ index, an approximation of the ventricle to brain volume using one 2D image slice, has been proposed but is not robust. The proposed approach is an effective way to quantify regions of interest and offers a computational method for predicting NPH. Methods . We propose a novel method to predict NPH by combining regions of interest segmented from CT scans with connectome data to compute features which capture the impact of enlarged ventricles by excluding fiber tracts passing through these regions. The segmentation and network features are used to train a model for NPH prediction. Results . Our method outperforms the current state-of-the-art by 9 precision points and 29 recall points. Our segmentation model outperforms the current state-of-the-art in segmenting the ventricle, gray-white matter, and subarachnoid space in CT scans. Conclusion . Our experimental results demonstrate that fast and accurate volumetric segmentation of CT brain scans can help improve the NPH diagnosis process, and network properties can increase NPH prediction accuracy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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