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Enregistrement W4205292417 · doi:10.21203/rs.3.rs-1135008/v1

Prediction of the Occurrence of Leprosy Reactions Based on Bayesian Networks

2022· preprint· en· W4205292417 sur OpenAlexaff
Rafael Saraiva de Andrade Rodrigues, Eduardo Ferreira José Heise, Luis Felipe Hartmann, Guilherme Eduardo Rocha, Márcia Olandoski, Mariane Martins de Araújo Stefani, Ana Carla Pereira Latini, Cléverson Teixeira Soares, Andréa de Faria Fernandes Belone, Patrícia Sammarco Rosa, Maria Araci de Andrade Pontes, Heitor de Sá Gonçalves, Rossilene Conceição da Silva Cruz, Maria Lúcia Fernandes Penna, Déborah Ribeiro Carvalho, Vinicius M. Fava, Samira Bührer-Sékula, Gerson Oliveira Penna, Cláudia Maria Cabral Moro, Júlio César Nievola, Marcelo Távora Mira

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLeprosy Research and Treatment
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorFundacion Araucaria
Mots-clésLeprosyBayesian probabilityBayesian networkComputer scienceArtificial intelligenceComputational biologyMachine learningMedicineBiologyImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background: Leprosy reactions (LR) are severe episodes of intense activation of the host inflammatory response, of uncertain etiology, today the leading cause of permanent nerve damage in leprosy patients. Several genetic and non-genetic risk factors for LR have been described; however, there are limited attempts to combine this information in order to estimate the risk of a leprosy patient to develop LR. Here we present an artificial intelligence (AI)-based system able to estimate risk of LR using clinical, demographic and genetic data. Methods: The study includes four datasets from different regions of Brazil, totalizing 1,450 leprosy patients followed prospectively for at least two years to assess the occurrence of LR. Data mining using WEKA software was performed following a two-step protocol to select the variables included in the AI system, based on Bayesian Networks and developed using the NETICA software. Results: Analysis of the complete database resulted in a system able to estimate LR-risk with 82.7% accuracy, 79.3% sensitivity, and 86.2% specificity. When using only databases for which host genetic information associated with LR was included, the performance increased to up to 87.7% accuracy, 85.7% sensitivity, and 89.4% specificity. Conclusion: We produced an easy-to-use, online, free-access system that allows the identification of leprosy patients at high risk of developing LR. Risk assessment of LR for individual patients may detect candidates close monitoring, with potential positive impact upon the prevention of permanent disabilities, the quality of life of the patients, as well as upon leprosy control programs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesIntégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,218
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,102
Tête enseignante GPT0,407
Écart entre enseignants0,305 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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