THE OMICRON VARIANT BREAKS THE EVOLUTIONARY LINEAGE OF SARS-COV2 VARIANTS
Notice bibliographique
Résumé
We analyze here 7 very first strains of OMICRON the SARS-CoV2 new variant from South Africa, the USA (California and Minesota), Canada and Belgium. We applied, at the scale of the whole genome and the spike gene, the biomathematics method of Fibonacci meta-structure fractal analysis applied to the UA / CG proportions. We have evidenced the RUPTURE of OMICRON with respect to ALL the previous variants: D614G, ALPHA, BETA, GAMMA, DELTA. Remarkably, it is observed that the density of OMICRON mutations in the SPIKE PRION region is more than 8 times that of the rest of the Spike protein. In particular, we suggest that the mRNA stabilizing secondary structure ("hairpin" conformation) in the spike of all variants is degraded in OMICRON, probably making its mRNA more fragile. The loss of long-range fractal meta-structures in the OMICRON spike gene are in line with common knowledge on the mechanisms of epidemic ending, involving recombination of heavily mutated RNA fragments of the virus, with the possible inference of a distinct helper virus. This would indicate that the SARS-CoV2 is under very strong evolutionary pressure, possibly marking the end of the pandemic. We are studying more particularly the prion-like region of the spike, the mutations rate of which is 8 times higher in OMICRON than that of the whole spike protein.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».