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Enregistrement W4205361528 · doi:10.3855/jidc.13664

Small interfering RNAs targeting agrA and sarA attenuate pathogenesis of Staphylococcus aureus in Caenorhabditis elegans

2021· article· en· W4205361528 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Infection in Developing Countries · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of Waterloo
Mots-clésAgraStaphylococcus aureusSmall interfering RNABiofilmGene silencingMicrobiologyBiologyRNA interferenceGeneCaenorhabditis elegansMessenger RNARNABacteriaMolecular biologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: The use of small interfering RNA (siRNA) gene silencing is a promising therapeutic option as it does not impose selective pressure on bacteria that is often associated with the development of resistance. The study assessed the effect of siRNA targeted to sarA and agrA in S. aureus and the relationship between the transcriptional response, biofilm formation and pathogenicity. METHODOLOGY: siRNAs designed against agrA and sarA were electroporated into methicillin-resistant and methicillin-susceptible S. aureus strains. mRNA levels, growth kinetics, biofilm formation and minimal inhibitory concentration were measured. Efficacy of siRNA in bacteria was assessed using survival assays in a C. elegans model. Differences in gene expression before and after siRNA treatment were anaysed using the paired t-test, while the log rank test was used to assess the significance of any difference among survival rates of nematodes. RESULTS: Biofilm formation decreased significantly in siRNA treated strains and growth rates of siRNA treated strains were significantly higher compared to untreated strains. We observed significant decreases in the transcriptional response in siRNA treated strains, with concomitant significant increases in the lifespan of C. elegans worms exposed to siRNA-treated versus untreated strains. CONCLUSIONS: siRNA targeted to agrA and sarA lowered mRNA transcription and pathogenicity of S. aureus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,195
Score d'incertitude au seuil0,342

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle