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Enregistrement W4205361528 · doi:10.3855/jidc.13664

Small interfering RNAs targeting agrA and sarA attenuate pathogenesis of Staphylococcus aureus in Caenorhabditis elegans

2021· article· en· W4205361528 sur OpenAlexfundno aff
Terissa Alexas Thompson, Paul Dean Brown

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Infection in Developing Countries · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of Waterloo
Mots-clésAgraStaphylococcus aureusSmall interfering RNABiofilmGene silencingMicrobiologyBiologyRNA interferenceGeneCaenorhabditis elegansMessenger RNARNABacteriaMolecular biologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: The use of small interfering RNA (siRNA) gene silencing is a promising therapeutic option as it does not impose selective pressure on bacteria that is often associated with the development of resistance. The study assessed the effect of siRNA targeted to sarA and agrA in S. aureus and the relationship between the transcriptional response, biofilm formation and pathogenicity. METHODOLOGY: siRNAs designed against agrA and sarA were electroporated into methicillin-resistant and methicillin-susceptible S. aureus strains. mRNA levels, growth kinetics, biofilm formation and minimal inhibitory concentration were measured. Efficacy of siRNA in bacteria was assessed using survival assays in a C. elegans model. Differences in gene expression before and after siRNA treatment were anaysed using the paired t-test, while the log rank test was used to assess the significance of any difference among survival rates of nematodes. RESULTS: Biofilm formation decreased significantly in siRNA treated strains and growth rates of siRNA treated strains were significantly higher compared to untreated strains. We observed significant decreases in the transcriptional response in siRNA treated strains, with concomitant significant increases in the lifespan of C. elegans worms exposed to siRNA-treated versus untreated strains. CONCLUSIONS: siRNA targeted to agrA and sarA lowered mRNA transcription and pathogenicity of S. aureus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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