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Enregistrement W4205452168 · doi:10.3410/f.4449960.4297058

Faculty Opinions recommendation of The mobile FG nucleoporin Nup98 is a cofactor for Crm1-dependent protein export.

2010· dataset· en· W4205452168 sur OpenAlexaff
Peter M. Lansdorp

Notice bibliographique

RevueFaculty Opinions – Post-Publication Peer Review of the Biomedical Literature · 2010
Typedataset
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNuclear Structure and Function
Établissements canadiensTerry Fox Research Institute
Organismes subventionnairesJapan Society for the Promotion of ScienceTakeda Science Foundation
Mots-clésNucleoporinNuclear export signalNuclear transportNuclear poreImportinCell biologyRanCell nucleusCytoplasmBiologyNuclear proteinMolecular biologyBiochemistryTranscription factorGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Nup98 is a mobile nucleoporin that forms distinct dots in the nucleus, and, although a role for Nup98 in nuclear transport has been suggested, its precise function remains unclear.Here, we show that Nup98 plays an important role in Crm1-mediated nuclear protein export.Nuclear, but not cytoplasmic, dots of EGFP-tagged Nup98 disappeared rapidly after cell treatment with leptomycin B, a specific inhibitor of the nuclear export receptor, Crm1.Mutational analysis demonstrated that Nup98 physically and functionally interacts with Crm1 in a RanGTP-dependent manner through its N-terminal phenylalanine-glycine (FG) repeat region.Moreover, the activity of the Nup98-Crm1 complex was modulated by RanBP3, a known cofactor for Crm1mediated nuclear export.Finally, cytoplasmic microinjection of anti-Nup98 inhibited the Crm1-dependent nuclear export of proteins, concomitant with the accumulation of anti-Nup98 in the nucleus.These results clearly demonstrate that Nup98 functions as a novel shuttling cofactor for Crm1-mediated nuclear export in conjunction with RanBP3.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,031
Score d'incertitude au seuil0,104

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,005
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0310,021

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,324
Écart entre enseignants0,307 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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