MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4205494371 · doi:10.3410/f.1018904.215492

Faculty Opinions recommendation of Zinc transporter LIVI controls epithelial-mesenchymal transition in zebrafish gastrula organizer.

2004· dataset· en· W4205494371 sur OpenAlexaff
Rudi Winklbauer

Notice bibliographique

RevueFaculty Opinions – Post-Publication Peer Review of the Biomedical Literature · 2004
Typedataset
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGastrulationZebrafishEpithelial–mesenchymal transitionBiologyCell biologyMesodermCell migrationSTAT3Cancer researchEmbryonic stem cellCellSignal transductionEmbryoMetastasisCancerEmbryogenesisGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Vertebrate gastrulation is a critical step in the establishment of body plan. During gastrulation, epithelial-mesenchymal transition (EMT) occurs. EMT is one of the central events of embryonic development, organ and tissue regeneration, and cancer metastasis. Signal transducers and activators of transcription (STATs) mediate biological actions such as cell proliferation, differentiation and survival in response to cytokines and growth factors, in a variety of biological processes. STATs are also important in EMT during gastrulation, organogenesis, wound healing and cancer progression. We previously showed that STAT3 is activated in the organizer during zebrafish gastrulation and its activity is essential for gastrulation movements. The requirement for STAT3 is cell-autonomous for the anterior migration of gastrula organizer cells, and non-cell-autonomous for the convergence of neighbouring cells. The molecular mechanisms of STAT's action in EMT, however, are unknown. Here we identify LIV1, a breast-cancer-associated zinc transporter protein, as a downstream target of STAT3 that is essential and sufficient for STAT3's cell-autonomous role in the EMT of zebrafish gastrula organizer cells. Furthermore, we demonstrate that LIV1 is essential for the nuclear localization of zinc-finger protein Snail, a master regulator of EMT. These results establish a molecular link between STAT3, LIV1 and Snail in EMT. PMID: 15129296

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,173
Score d'incertitude au seuil0,580

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,1730,070

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueFaculty Opinions – Post-Publication Peer Review of the Biomedical LiteratureMême sujetMicroRNA in disease regulationTravaux en français237 207