MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4205510064 · doi:10.5858/arpa.2020-0643-le

In Reply

2021· letter· en· W4205510064 sur OpenAlexaboutno aff
Lauren A. Beste, Michael Icardi, Christine M. Hunt, Ina Gylys-Colwell, Elliott Lowy, Leslie Taylor, Timothy R. Morgan, Michael F. Chang, Marissa Maier, Ramsey Cheung

Notice bibliographique

RevueArchives of Pathology & Laboratory Medicine · 2021
Typeletter
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueClinical Laboratory Practices and Quality Control
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesRoy J. and Lucille A. Carver College of Medicine, University of IowaUniversity of California, IrvineUniversity of WashingtonHealth Services Research and Development
Mots-clésContext (archaeology)HarmonizationAlanine aminotransferaseMedicineMedical physicsCertificationInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In Reply.—Current US guidelines that endorse universal alanine aminotransferase (ALT) thresholds to define “normal” values1 are problematic and could result in unnecessary clinical interventions. In our 5-year national Veterans Health Administration analysis, we reported clinically significant differences in ALT measurements in analyzers by 5 manufacturers. We analyzed more than 22 000 samples using external ALT proficiency testing with standardized College of American Pathologists samples which, as we point out in our manuscript,2 are not commutable with human samples.3 Our findings closely align with a Canadian national study (performed with pooled human blood samples) and an Indiana statewide study demonstrating that ALT measurements vary significantly across North American analyzers.4,5 Taken in the context of this prior work, our observed lack of harmonization in ALT assays affirms that universal ALT thresholds should be avoided as a trigger for clinical action until analyzers and ALT proficiency testing materials are standardized.Proficiency testing material allows comparisons of analytical performance across systems and is used in the daily calibration and equipment maintenance procedures to enable measurement of patient samples to guide treatment decisions. We note that if proficiency testing material were entirely noncommutable, this would not be possible. Nevertheless, our aim was not to quantify the absolute differences between manufacturer systems, which would require the use of split samples and parallel testing. Rather, our goal was to illustrate the problems inherent in uncritically applying universal ALT thresholds given the lack of a sufficiently commutable “standardized” testing material.While a European certified reference material for ALT is commercially available, the use of a single “international reference” material is impractical from an operational viewpoint. As occurred with the World Health Organization thromboplastin for the international normalized ratio, the standard may eventually be depleted. Reliance on a global certified reference standard produced by a single source is inadvisable.The test platforms for the 5 analyzers we studied have differing reference ranges within the same patient population. This key finding affirms the need to examine the reference range when interpreting ALT data for each analyzer, as they are not standardized. We fully endorse the authors' concluding statement, “By appropriately establishing reference ranges, medical decisions will not be hindered by misinterpretations…”.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,046
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: Commentaire
Score de désaccord entre enseignants0,055
Score d'incertitude au seuil0,000

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,046
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0030,003
Communication savante0,0050,006
Science ouverte0,0030,004
Intégrité de la recherche0,0210,029
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0550,050

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,362
Écart entre enseignants0,317 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueArchives of Pathology & Laboratory MedicineMême sujetClinical Laboratory Practices and Quality ControlTravaux en français237 207