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Enregistrement W4205665182 · doi:10.1111/jpy.13232

The possible fates of <i>Fragilariopsis cylindrus</i> (polar diatom) cells exposed to prolonged darkness

2022· article· en· W4205665182 sur OpenAlexafffund
Théo Sciandra, Marie‐Hélène Forget, Flavienne Bruyant, Marine Béguin, Thomas Lacour, Chris Bowler, Marcel Babin

Notice bibliographique

RevueJournal of Phycology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineEnergy
ThématiqueAlgal biology and biofuel production
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesArcticNetCanada First Research Excellence FundCanada Excellence Research Chairs, Government of CanadaHuman Frontier Science ProgramFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesUniversité Laval
Mots-clésBiologyDiatomDarknessPolarOceanographyBotanyAstronomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

At high latitudes, the polar night poses a great challenge to photosynthetic organisms that must survive up to six months without light. Numerous studies have already shed light on the physiological changes involved in the acclimation of microalgae to prolonged darkness and subsequent re-illumination. However, these studies have never considered inter-individual variability because they have mainly been conducted with bulk measurements. On the other hand, such long periods are likely to impact within-population selection processes. In this study, we hypothesized that distinct subpopulations with specific traits may emerge during acclimation of a population of diatoms to darkness. We addressed this hypothesis using flow cytometry (FCM), which allow to individually characterize large numbers of cells. The ecologically dominant polar pennate diatom Fragilariopsis cylindrus was subjected to three dark acclimation (DA) experiments of one, three, and five months duration, during which all cultures showed signs of recovery once light became available again. Our results suggest that darkness survival of F. cylindrus relies on reduction of metabolic activity and consumption of carbon reserves. In addition, FCM allowed us to record three different causes of death, each shared by significant numbers of individuals. The first rendered cells were unable to survive the stress caused by the return to light, probably due to a lack of sufficient photoprotective defenses. The other two were observed in two subpopulations of cells whose physiological state deviated from the original population. The data suggest that starvation and failure to maintain dormancy were the cause of cell mortality in these two subpopulations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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