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Enregistrement W4205697470 · doi:10.1073/pnas.2111452118

An open repository of real-time COVID-19 indicators

2021· article· en· W4205697470 sur OpenAlexaff
Alex Reinhart, Logan Brooks, Maria Jahja, Aaron Rumack, Jingjing Tang, Sumit Agrawal, Wael Al Saeed, Taylor Arnold, Amartya Basu, Jacob Bien, Ángel Alexander Cabrera, Andrew I. Chin, Eu Jing Chua, Brian Clark, Sarah Colquhoun, Nat DeFries, David Farrow, Jodi Forlizzi, Jed Grabman, Samuel Gratzl, Alden Green, George Haff, Robin Han, Kate Harwood, Addison J. Hu, Raphael Hyde, Sangwon Hyun, Ananya Joshi, Jimi Kim, Andrew Kuznetsov, Wichada La Motte‐Kerr, Yeonjin Lee, Kenneth Lee, Zachary C. Lipton, Michael X. Liu, Lester Mackey, Kathryn Mazaitis, Daniel J. McDonald, Phillip McGuinness, Balasubramanian Narasimhan, Michael P. O’Brien, Natalia L. Oliveira, Pratik Patil, Adam Perer, Collin A. Politsch, Samyak Rajanala, Dawn Rucker, Chris Scott, Nigam H. Shah, Vishnu Shankar, James Sharpnack, Dmitry Shemetov, Noah Simon, Benjamin Y. Smith, Vishakha Srivastava, Shuyi Tan, Robert Tibshirani, Elena Tuzhilina, Ana Karina Van Nortwick, Valérie Ventura, Larry Wasserman, Benjamin Alan Weaver, Jeremy C. Weiss, Spencer Whitman, Kristin Williams, Roni Rosenfeld, Ryan J. Tibshirani

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueData-Driven Disease Surveillance
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCenter for Machine Learning and Health, School of Computer Science, Carnegie Mellon UniversityCenters for Disease Control and PreventionAmazon Web ServicesNational Science Foundation
Mots-clésCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Social distancePandemicPublic healthInternet privacySevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)2019-20 coronavirus outbreakThe InternetPopulationData scienceComputer scienceActuarial scienceMedicineBusinessEnvironmental healthWorld Wide WebNursing

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The COVID-19 pandemic presented enormous data challenges in the United States. Policy makers, epidemiological modelers, and health researchers all require up-to-date data on the pandemic and relevant public behavior, ideally at fine spatial and temporal resolution. The COVIDcast API is our attempt to fill this need: Operational since April 2020, it provides open access to both traditional public health surveillance signals (cases, deaths, and hospitalizations) and many auxiliary indicators of COVID-19 activity, such as signals extracted from deidentified medical claims data, massive online surveys, cell phone mobility data, and internet search trends. These are available at a fine geographic resolution (mostly at the county level) and are updated daily. The COVIDcast API also tracks all revisions to historical data, allowing modelers to account for the frequent revisions and backfill that are common for many public health data sources. All of the data are available in a common format through the API and accompanying R and Python software packages. This paper describes the data sources and signals, and provides examples demonstrating that the auxiliary signals in the COVIDcast API present information relevant to tracking COVID activity, augmenting traditional public health reporting and empowering research and decision-making.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,008
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,052
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesScience ouverte
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,996
Score d'incertitude au seuil0,141

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0080,052
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0080,012
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0070,005
Science ouverte0,0040,006
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0420,048

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,368
Écart entre enseignants0,325 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations72
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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