Faculty Opinions recommendation of Role of double-stranded RNA pattern recognition receptors in rhinovirus-induced airway epithelial cell responses.
Notice bibliographique
Résumé
Rhinovirus (RV), a single-stranded RNA virus of the picornavirus family, is a major cause of the common cold as well as asthma and chronic obstructive pulmonary disease exacerbations.Viral double-stranded RNA produced during replication may be recognized by the host pattern recognition receptors Toll-like receptor (TLR)-3, retinoic acid inducible gene (RIG)-I and melanoma-differentiation-associated gene (MDA)-5.No study has yet identified the receptor required for sensing RV double-stranded (ds)-RNA.To examine this, BEAS-2B human bronchial epithelial cells were infected with intact RV-1B or replication-deficient UV-irradiated virus, and interferon (IFN) and IFN-stimulated gene expression determined by quantitative PCR.The separate requirements of RIG-I, MDA5 and IFN response factor (IRF)-3 were determined using their respective siRNAs.The requirement of TLR3 was determined using siRNA against the TLR3 adaptor molecule TRIF.Intact RV-1B, but not UV-irradiated RV, induced IRF3 phosphorylation and dimerization, as well as mRNA expression of IFN-β̤ , IFN-λ̣ 1, IFN-λ2/3, IRF7, RIG-I, MDA5, IP-10/CXCL10, IL-8/CXCL8 and GM-CSF.siRNA against IRF3, MDA5 and TRIF, but not RIG-I, decreased RV1B-induced expression of IFN-β̤ IFN-λ̣ 1, IFN-λ2/3, IRF7, RIG-I, MDA5 and IP-10/CXCL10, but had no effect on IL-8/CXCL8 and GM-CSF.siRNAs against MDA5 and TRIF also reduced IRF3 dimerization.Finally, in primary cells, transfection with MDA5 siRNA significantly reduced IFN expression, as it did in BEAS-2B cells.These results suggest that TLR3 and MDA5, but not RIG-I, are required for maximal sensing of RV dsRNA, and that TLR3 and MDA5 signal through a common downstream signaling intermediate, IRF3.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,008 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,005 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,004 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,409 | 0,243 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».