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Enregistrement W4205882647 · doi:10.22215/etd/2021-14760

A Winter's Tale: MicroRNA Biogenesis and Regulation in the Freeze-Tolerant Grey Tree Frog, Hyla Versicolor

2021· dissertation· en· W4205882647 sur OpenAlexaff
W. Aline Ingelson‐Filpula

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typedissertation
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePhysiological and biochemical adaptations
Établissements canadiensCarleton University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologymicroRNARibosomal proteinGeneHylaDownregulation and upregulationBiogenesisGene expressionCell biologyMitochondrial biogenesisRNAGeneticsRibosomeEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Grey tree frogs (Hyla versicolor) can endure full-body freezing over the winter, with survival aided by metabolic rate depression.Post-transcriptional controls on gene expression include microRNA regulation of gene transcripts that can aid implementation of protein changes required for freezing survival.Western immunoblotting was used to examine protein expression levels of the miRNA biogenesis pathway in three tissues.During freezing, four proteins were upregulated in liver, whereas four proteins in muscle and five proteins in kidney were downregulated.Small RNA-sequencing and bioinformatic analysis of liver showed that seven miRNAs were freeze-upregulated and four were freeze-downregulated. Functions for these miRNAs may involve inhibition of signaling pathways, apoptosis, and nuclear processes.Interestingly, miRNAs may enhance ribosomal biogenesis.Overall, the data show miRNA biosynthesis is altered during freezing and differentially regulated across tissues, with computational predictions highlighting specific functions and processes that may be disproportionally altered during freezing.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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