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Enregistrement W4205909584 · doi:10.22215/etd/2021-14702

Roles of Inflammatory Signaling and MicroRNA in the Adipose Stress Response of Hibernating Ictidomys Tridecemlineatus

2021· dissertation· en· W4205909584 sur OpenAlexaff
Samantha M. Logan

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typedissertation
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdipose Tissue and Metabolism
Établissements canadiensCarleton UniversityCanada's Michael Smith Genome Sciences Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTorporBiologyBrown adipose tissueEndocrinologyInternal medicineWhite adipose tissueInflammasomeInflammationHibernation (computing)Adipose tissueCell biologyImmunologyMedicineThermoregulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hibernating ground squirrels have an interesting ability to avoid organ dysfunction despite months of obesity, starvation, and low body temperature.However, pro-inflammatory signaling and conserved miRNA expression patterns have yet to be investigated in white and brown adipose tissues (WAT, BAT), organs with roles in fat storage and heat production, respectively.The inflammasome was activated in BAT during torpor and arousal relative to the control, as evidenced by increased inflammasome priming, elevated protein levels of NLRP3, AIM2, cleaved gasdermin D and IL-18, as well as increased caspase-1 activity.By contrast, caspase-1 activity, the ultimate indicator of inflammasome activation, was decreased during torpor and arousal in WAT relative to the euthermic control.Pro-inflammatory cytokines, matrix metalloproteinases (MMPs), and their inhibitors were also investigated to determine if cytokines and tissue remodeling proteins could be important in the stress response in hibernator adipose tissue.An increase in IL-1α during torpor in BAT furthered the idea that BAT may use proinflammatory pathways as part of the response to cell stress.By contrast, the only change in WAT was a decrease in the total protein levels of MMP2, suggesting tissue remodeling may not be important in the maintenance of WAT homeostasis.Finally, conserved BAT and WAT miRNAs were analyzed.There was an association between the BAT miRNA expression profile and condition (control or torpor), but no association between the two variables in WAT.Consistently, fewer miRNAs were differentially expressed in WAT than BAT, with more being downregulated than upregulated.As expected, microRNAs were predicted to inhibit energy expensive pathways during torpor in both tissues, suggesting an important role for non-coding RNAs in the regulation of metabolic rate suppression.Unexpectedly, KEGG pathway analysis suggested miRNAs were less likely to target pathways involved in damage sensing and wound repair in BAT, and DNA damage repair in WAT.Together, the data in this thesis suggest an iii upregulation of stress sensing and response in BAT in torpid and arousing ground squirrels through the regulation of inflammasomes, inflammatory signaling, and miRNA expression.By contrast, DNA repair may be increased in WAT but generally, pro-inflammatory pathways were suppressed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
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