Roles of Inflammatory Signaling and MicroRNA in the Adipose Stress Response of Hibernating Ictidomys Tridecemlineatus
Notice bibliographique
Résumé
Hibernating ground squirrels have an interesting ability to avoid organ dysfunction despite months of obesity, starvation, and low body temperature.However, pro-inflammatory signaling and conserved miRNA expression patterns have yet to be investigated in white and brown adipose tissues (WAT, BAT), organs with roles in fat storage and heat production, respectively.The inflammasome was activated in BAT during torpor and arousal relative to the control, as evidenced by increased inflammasome priming, elevated protein levels of NLRP3, AIM2, cleaved gasdermin D and IL-18, as well as increased caspase-1 activity.By contrast, caspase-1 activity, the ultimate indicator of inflammasome activation, was decreased during torpor and arousal in WAT relative to the euthermic control.Pro-inflammatory cytokines, matrix metalloproteinases (MMPs), and their inhibitors were also investigated to determine if cytokines and tissue remodeling proteins could be important in the stress response in hibernator adipose tissue.An increase in IL-1α during torpor in BAT furthered the idea that BAT may use proinflammatory pathways as part of the response to cell stress.By contrast, the only change in WAT was a decrease in the total protein levels of MMP2, suggesting tissue remodeling may not be important in the maintenance of WAT homeostasis.Finally, conserved BAT and WAT miRNAs were analyzed.There was an association between the BAT miRNA expression profile and condition (control or torpor), but no association between the two variables in WAT.Consistently, fewer miRNAs were differentially expressed in WAT than BAT, with more being downregulated than upregulated.As expected, microRNAs were predicted to inhibit energy expensive pathways during torpor in both tissues, suggesting an important role for non-coding RNAs in the regulation of metabolic rate suppression.Unexpectedly, KEGG pathway analysis suggested miRNAs were less likely to target pathways involved in damage sensing and wound repair in BAT, and DNA damage repair in WAT.Together, the data in this thesis suggest an iii upregulation of stress sensing and response in BAT in torpid and arousing ground squirrels through the regulation of inflammasomes, inflammatory signaling, and miRNA expression.By contrast, DNA repair may be increased in WAT but generally, pro-inflammatory pathways were suppressed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».