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Enregistrement W4205916008 · doi:10.1016/j.funbio.2021.12.005

FocECM33, a GPI-anchored protein, regulates vegetative growth and virulence in Fusarium oxysporum f. sp. cubense tropical race 4

2022· article· en· W4205916008 sur OpenAlexaff
H. C. Huang, Xiaoxia Zhang, Yong Zhang, Ganjun Yi, Jianghui Xie, Altus Viljoen, Wei Wang, Diane Mostert, Gang Fu, Changcao Peng, Dandan Xiang, Chunyu Li, Siwen Liu

Notice bibliographique

RevueFungal Biology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensMinistry of Agriculture
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFusarium oxysporum f.sp. cubenseBiologyVirulenceFusarium oxysporumHyphaMutantMicrobiologyCell wallChitinTranscriptomeFusarium wiltGeneCell biologyBotanyGene expressionGeneticsBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ECM33, a glycosylphosphatidylinositol (GPI)-anchored protein, is important for fungal development and infection through regulating fungal cell wall integrity, however, the functions of its orthologs in pathogenesis have not been characterized in Fusarium oxysporum. Here, we discovered a GPI-anchored protein, FocECM33, which is required for vegetative growth and virulence of Fusasium oxysporum f. sp. cubense tropical race 4 (Foc TR4). FocECM33 was highly upregulated during the early infection process of Foc TR4 in banana roots. The targeted disruption of FocECM33 led to decreased hyphal growth, increased sensitivity to cell wall stresses and reduced virulence on banana plantlets. Furthermore, ΔFocECM33 mutant demonstrated a cell morphology defect, elevated ROS production and increased chitin content. Transcriptome analysis showed that FocECM33 has a significant influence on the production of various secondary metabolites and regulation of many biosynthetic processes in Foc TR4. Taken together, it seems FocECM33 contributes to the virulence of Foc TR4 through regulating the process of hyphal growth, ROS production and chitin synthesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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