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Enregistrement W4205917292 · doi:10.3389/fimmu.2021.773581

Radiomics Assessment of the Tumor Immune Microenvironment to Predict Outcomes in Breast Cancer

2022· article· en· W4205917292 sur OpenAlex
Xiaorui Han, Wuteng Cao, Lei Wu, Changhong Liang

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Immunology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRadiomics and Machine Learning in Medical Imaging
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesHigh-level Hospital Construction Project of Guangdong Provincial People's HospitalChina Postdoctoral Science FoundationNational Natural Science Foundation of ChinaUniversity of AlbertaNational Science Foundation
Mots-clésRadiomicsTumor microenvironmentBreast cancerMedicineImmune systemOncologyCancerInternal medicineCancer researchImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background The immune microenvironment of tumors provides information on prognosis and prediction. A prior validation of the immunoscore for breast cancer (IS BC ) was made on the basis of a systematic assessment of immune landscapes extrapolated from a large number of neoplastic transcripts. Our goal was to develop a non-invasive radiomics-based IS BC predictive factor. Methods Immunocell fractions of 22 different categories were evaluated using CIBERSORT on the basis of a large, open breast cancer cohort derived from comprehensive information on gene expression. The IS BC was constructed using the LASSO Cox regression model derived from the Immunocell type scores, with 479 quantified features in the intratumoral and peritumoral regions as observed from DCE-MRI. A radiomics signature [radiomics ImmunoScore (RIS)] was developed for the prediction of IS BC using a random forest machine-learning algorithm, and we further evaluated its relationship with prognosis. Results An IS BC consisting of seven different immune cells was established through the use of a LASSO model. Multivariate analyses showed that the IS BC was an independent risk factor in prognosis (HR=2.42, with a 95% CI of 1.49–3.93; P<0.01). A radiomic signature of 21 features of the IS BC was then exploited and validated (the areas under the curve [AUC] were 0.899 and 0.815). We uncovered statistical associations between the RIS signature with recurrence-free and overall survival rates (both P<0.05). Conclusions The RIS is a valuable instrument with which to assess the immunoscore, and offers important implications for the prognosis of breast cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,425

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle