MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4205966685 · doi:10.1093/braincomms/fcab245

Variants in <i>ATP6V0A1</i> cause progressive myoclonus epilepsy and developmental and epileptic encephalopathy

2021· article· en· W4205966685 sur OpenAlexaff
Laura C. Bott, Mitra Forouhan, Maria Lieto, Ambre J. Sala, Ruth Ellerington, Janel O. Johnson, Alfina A. Speciale, Chiara Criscuolo, Alessandro Filla, David Chitayat, Ebba Alkhunaizi, Patrick Shannon, Andrea H. Németh, Domenica Taruscio, Marco Salvatore, Agata Polizzi, Federica Censi, Giovanna Floridia, Giuseppe Novelli, Erica Daina, Alessandra Ferlini, Marcella Neri, Dario Roccatello, Simone Baldovino, Elisa Menegatti, Francesco Angelucci, Wooi Fang Lim, Pasquale Striano, Federico Zara, Ingo Helbig, Mikko Muona, Carolina Courage, Anna‐Elina Lehesjoki, Samuel F. Berkovic, Nancy Pinnell, Dallas Reed, Peter D. Turnpenny, Jacqueline Eason, Leah Fleming, Kirsty McWalter, Kali Juliette, Paul J. Benke, Xilma R. Ortiz‐González, Sarah McKeown, Amisha B Patel, Matthew Osmond, Jagdeep S. Walia, Xianru Jiao, Zhixian Yang, Boris Keren, Perrine Charles, Ashish R. Deshwar, Kenneth H. Fischbeck, Francesco Brancati, Richard I. Morimoto, Matthew J. A. Wood

Notice bibliographique

RevueBrain Communications · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Neurodevelopmental Disorders
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of TorontoSickKids FoundationMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesNational Institute on AgingNational Institutes of HealthAction Medical ResearchWellcome Trust
Mots-clésEpilepsyMyoclonusProgressive myoclonus epilepsyEncephalopathyNeurosciencePsychologyMedicinePediatricsPsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The vacuolar H+-ATPase is a large multi-subunit proton pump, composed of an integral membrane V0 domain, involved in proton translocation, and a peripheral V1 domain, catalysing ATP hydrolysis. This complex is widely distributed on the membrane of various subcellular organelles, such as endosomes and lysosomes, and plays a critical role in cellular processes ranging from autophagy to protein trafficking and endocytosis. Variants in ATP6V0A1, the brain-enriched isoform in the V0 domain, have been recently associated with developmental delay and epilepsy in four individuals. Here, we identified 17 individuals from 14 unrelated families with both with new and previously characterized variants in this gene, representing the largest cohort to date. Five affected subjects with biallelic variants in this gene presented with a phenotype of early-onset progressive myoclonus epilepsy with ataxia, while 12 individuals carried de novo missense variants and showed severe developmental and epileptic encephalopathy. The R740Q mutation, which alone accounts for almost 50% of the mutations identified among our cases, leads to failure of lysosomal hydrolysis by directly impairing acidification of the endolysosomal compartment, causing autophagic dysfunction and severe developmental defect in Caenorhabditis elegans. Altogether, our findings further expand the neurological phenotype associated with variants in this gene and provide a direct link with endolysosomal acidification in the pathophysiology of ATP6V0A1-related conditions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBrain CommunicationsMême sujetGenetics and Neurodevelopmental DisordersTravaux en français237 207