MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4206022247 · doi:10.7901/2169-3358-2021.1.800005

Characterization of the Microbial Community Structure and Function During the Natural Attenuation of Oil in Marine Environments Using In Situ Microcosms

2021· article· en· W4206022247 sur OpenAlexaffabout
Charles W. Greer, Nathalie Fortin, Benjamin de Jourdan, Tahereh Boloori, Julien Tremblay, Alexa Bakker, Jessica Wasserscheid, Susan E. Cobanli, Brian Robinson, Tom King, Lyle G. Whyte, Kenneth Lee

Notice bibliographique

RevueInternational Oil Spill Conference Proceedings · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial bioremediation and biosurfactants
Établissements canadiensFisheries and Oceans CanadaHuntsman Marine Science CentreMcGill UniversityNational Research Council Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMicrocosmEnvironmental scienceContext (archaeology)Microbial population biologyEnvironmental remediationPetroleumEnvironmental chemistryNatural (archaeology)ContaminationEcologyGeologyChemistryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Climate change, the opening of the northwest passage, the production and transportation of oil reserves in addition to the large size and number of ocean-going vessels, are putting all Canada's oceans at an elevated risk for an oil spill. Responses to marine oil spills include physical (skimming and recovery), chemical (dispersants, herders) and biological processes (biodegradation). Natural attenuation, a weathering process that includes physical, chemical and biological action on spilled oil, is a potential remediation strategy that needs to be explored and exploited. In the Canadian context, we are using genomics approaches to better understand the natural populations of oil degrading microorganisms in our oceans, their diversity, spatial and temporal dynamics, and locations that may be more vulnerable to oil spills. The purpose of this study was to perform an evaluation of the effectiveness of an in situ microcosm experimental system to study indigenous microbial communities that have oil degrading potential and to determine whether this experimental system could have an impact on acute toxicity to various marine organisms. In situ microcosms are slitted columns that contain support matrices such as clay beads or river rocks, with or without an oil coating. Columns can be incubated in different locations, at different depths and different time periods, during which microbial biofilm develops on the support materials. By using oil coated and uncoated matrices, comparative microbial community data that demonstrates the response of the microbial community to the presence of oil can be obtained. Long-term incubations (1 year) conducted at CFS-Alert showed that known oil-degrading bacteria (Colwellia, Oleibacter, Thalassolituus, Cycloclasticus, Oceanobacter and Alcanivorax) became dominant only on the oil coated matrices, confirming their presence in the local seawater. Acute toxicity tests were performed in aquaria on a variety of test organisms to evaluate the possible effects of oil components leaching into the water from the in situ microcosms. Limited and transient toxicity to only two tested organisms (green sea urchin fertilization and green algal growth). Considering the analyses were conducted in a closed circulation system, it is highly likely that in an open ocean environment, toxicity would be negligible. Data from these studies will be valuable to support guidelines for the exploitation of natural attenuation as an alternative response measure (ARM) to address oil spills in Canadian waters.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,280
Score d'incertitude au seuil0,269

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,206
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueInternational Oil Spill Conference ProceedingsMême sujetMicrobial bioremediation and biosurfactantsTravaux en français237 207