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Enregistrement W4206028156 · doi:10.1093/zoolinnean/zlab126

Leech anticoagulants are ancestral and likely to be multifunctional

2021· article· en· W4206028156 sur OpenAlexaff
Rafael Eiji Iwama, Michael Tessler, Sebastian Kvist

Notice bibliographique

RevueZoological Journal of the Linnean Society · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLeech Biology and Applications
Établissements canadiensRoyal Ontario MuseumUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Science Foundation
Mots-clésLeechBiologyEvolutionary biologyFunction (biology)Selection (genetic algorithm)Sister groupGeneGeneticsZoologyPhylogeneticsClade

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Bloodfeeding leeches have powerful anticoagulants that allow them to feed for extended periods. However, many leech species are predatory rather than bloodfeeding. It is not known whether they express these proteins and whether the proteins are co-opted for other purposes. Little is known about salivary secretions of the sister groups of leeches, where blood is not part of the diet. We screened the transcriptomes of four non-bloodfeeding leeches and four leech relatives to identify major lineages of anticoagulant genes, helping to determine their evolutionary origin and maintenance. We estimated selection regimes that are expected after a change in feeding behaviour. We found widespread presence of putative anticoagulants, although our results also indicate that several of these are members of multicopy gene families. Our analyses suggest that homologues to leech anticoagulants were already present before the origin of bloodfeeding in leeches and that negative selection is the major driver of evolutionary rates even in non-bloodfeeding taxa. These results point to the retention of the original function by these molecules in non-bloodfeeding species. Ultimately, the proteins might not be involved in bloodfeeding or it seems likely that their putative pleiotropic effects are of great importance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,064
Tête enseignante GPT0,310
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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