Stage‐Specific Generation of Human Pluripotent Stem Cell Derived Lung Models to Measure CFTR Function
Notice bibliographique
Résumé
Human embryonic stem cells (ES) and induced pluripotent stem cells (iPSC) are powerful tools that have the potential to generate in vitro human lung epithelial cells. However, challenges in efficiency and reproducibility remain in utilizing the cells for therapy discovery platforms. Here, we optimize our previously published protocols to efficiently generate three developmental stages of the lung model (fetal lung epithelial progenitors, fLEP; immature airway epithelial spheroid, AES; air-liquid interface culture, ALI), and demonstrate its potential for cystic fibrosis (CF) drug discovery platforms. The stepwise approach directs differentiation from hPSC to definitive endoderm, anterior ventral foregut endoderm, and fetal lung progenitor cells. The article also describes the generation of immature airway epithelial spheroids in Matrigel with epithelial cells sorted by a magnetic-activated cell sorting system, and the generation of adult-like airway epithelia through air-liquid interface conditions. We demonstrate that this optimized procedure generates remarkably higher cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) expression and function than our previous method, and thus is uniquely suitable for CF research applications. © 2022 The Authors. Current Protocols published by Wiley Periodicals LLC. Basic Protocol 1: hESC/hiPSC differentiation to fetal lung progenitors Basic Protocol 2: Formation of airway epithelial spheroids Alternate Protocol 1: Cryopreservation of airway epithelial spheroids Basic Protocol 3: Differentiation and maturation in air-liquid interface culture Alternate Protocol 2: Differentiation and maturation of epithelial progenitors from airway epithelial spheroids in ALI culture.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».