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Enregistrement W4206088707 · doi:10.1002/cpz1.341

Stage‐Specific Generation of Human Pluripotent Stem Cell Derived Lung Models to Measure CFTR Function

2022· article· en· W4206088707 sur OpenAlexaff
Shuk Yee Ngan, Henry Quach, Onofrio Laselva, Elena N. Huang, Maria Mangos, Sunny Xia, Christine E. Bear, Amy P. Wong

Notice bibliographique

RevueCurrent Protocols · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeonatal Respiratory Health Research
Établissements canadiensUniversity of TorontoHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInduced pluripotent stem cellCell biologyProgenitor cellEndodermStem cellBiologyEmbryonic stem cellCystic fibrosisMatrigelDirected differentiationCellular differentiationImmunologyCancer researchAngiogenesis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human embryonic stem cells (ES) and induced pluripotent stem cells (iPSC) are powerful tools that have the potential to generate in vitro human lung epithelial cells. However, challenges in efficiency and reproducibility remain in utilizing the cells for therapy discovery platforms. Here, we optimize our previously published protocols to efficiently generate three developmental stages of the lung model (fetal lung epithelial progenitors, fLEP; immature airway epithelial spheroid, AES; air-liquid interface culture, ALI), and demonstrate its potential for cystic fibrosis (CF) drug discovery platforms. The stepwise approach directs differentiation from hPSC to definitive endoderm, anterior ventral foregut endoderm, and fetal lung progenitor cells. The article also describes the generation of immature airway epithelial spheroids in Matrigel with epithelial cells sorted by a magnetic-activated cell sorting system, and the generation of adult-like airway epithelia through air-liquid interface conditions. We demonstrate that this optimized procedure generates remarkably higher cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) expression and function than our previous method, and thus is uniquely suitable for CF research applications. © 2022 The Authors. Current Protocols published by Wiley Periodicals LLC. Basic Protocol 1: hESC/hiPSC differentiation to fetal lung progenitors Basic Protocol 2: Formation of airway epithelial spheroids Alternate Protocol 1: Cryopreservation of airway epithelial spheroids Basic Protocol 3: Differentiation and maturation in air-liquid interface culture Alternate Protocol 2: Differentiation and maturation of epithelial progenitors from airway epithelial spheroids in ALI culture.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,337
Tête enseignante GPT0,429
Écart entre enseignants0,092 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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