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Enregistrement W4206103793 · doi:10.2196/29803

Identification of Prediabetes Discussions in Unstructured Clinical Documentation: Validation of a Natural Language Processing Algorithm

2021· article· en· W4206103793 sur OpenAlexvenueno aff
Jessica L. Schwartz, Eva Tseng, Nisa M. Maruthur, Masoud Rouhizadeh

Notice bibliographique

RevueJMIR Medical Informatics · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiomedical Text Mining and Ontologies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Heart, Lung, and Blood InstituteJohns Hopkins University
Mots-clésPrediabetesDocumentationComputer scienceArtificial intelligenceMachine learningPsychological interventionNatural language processingMedicineNursing

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Prediabetes affects 1 in 3 US adults. Most are not receiving evidence-based interventions, so understanding how providers discuss prediabetes with patients will inform how to improve their care. OBJECTIVE: This study aimed to develop a natural language processing (NLP) algorithm using machine learning techniques to identify discussions of prediabetes in narrative documentation. METHODS: We developed and applied a keyword search strategy to identify discussions of prediabetes in clinical documentation for patients with prediabetes. We manually reviewed matching notes to determine which represented actual prediabetes discussions. We applied 7 machine learning models against our manual annotation. RESULTS: Machine learning classifiers were able to achieve classification results that were close to human performance with up to 98% precision and recall to identify prediabetes discussions in clinical documentation. CONCLUSIONS: We demonstrated that prediabetes discussions can be accurately identified using an NLP algorithm. This approach can be used to understand and identify prediabetes management practices in primary care, thereby informing interventions to improve guideline-concordant care.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,966
Score d'incertitude au seuil0,216

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,355
Écart entre enseignants0,345 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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