MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4206123244 · doi:10.22215/etd/2019-14737

Elucidating the Role of LRRK2 Kinase Activity in the Innate Immune System

2019· dissertation· en· W4206123244 sur OpenAlexaff
Michaela Lunn

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typedissertation
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParkinson's Disease Mechanisms and Treatments
Établissements canadiensCarleton University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLRRK2Innate immune systemImmune systemContext (archaeology)BiologyKinaseDiseaseImmunologyMutationFunction (biology)GeneGeneticsMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mutations in LRRK2 are linked to three distinct diseases: Parkinson's disease (PD), Crohn's disease, and leprosy.The main pathogenic variant of LRRK2 associated with Parkinson's disease is the p.G2019S mutant, which causes increased kinase activity of the protein.Recently, a role for LRRK2 has been implicated in the immune system; however, the exact contribution of the kinase activity in this function remains unknown.We have used mice with a Lrrk2 knock-in p.D1994S mutation, which renders the protein kinase-dead, and three distinct infection paradigms to investigate this role: a systemic, nasal inoculation of reovirus serotype-3 Dearing (T3D); an intracerebral, direct-brain infection of reovirus T3D (both cause encephalitis); and a systemic, peripheral infection by Salmonella typhimurium (causing sepsis).Lrrk2 kinase-dead mice have increased survival compared to wild-type mice following a systemic reovirus T3D infection, with a slight increase in viral titre in the lungs at the early stage of disease.Nevertheless, loss of Lrrk2 kinase activity had no effect on survival from sepsis or bacterial load following i.v.inoculation.Lastly, Lrrk2 kinase-dead mice had the same survival rate as wild-type mice following a direct-brain infection by reovirus T3D.We demonstrated that in the context of both systemic infection models (i.e., viral and bacterial) Lrrk2 kinase is not required for the host's immune response to control virulent pathogens (when compared with wild-type Lrrk2 expression) and may in fact be protective in certain paradigms (i.e., systemic reovirus infection leading to encephalitis).Additionally, we have shown that Lrrk2 seems to exert its immune function predominantly in the periphery rather than the brain, and that the p.G2019S mutation confers a gain-of-function.Taken together, these data will provide important insights into LRRK2 biology, PD pathogenesis, and cause-directed therapies for all three diseases affected by allelic variants at this locus.A very special thank you to additional equally important mentors: Dr. Julianna Tomlinson, Dr. Bojan Shutinoski, and Dr. Earl Brown.Julie, thank you for being an amazing mentor, giving me advice on anything I ask, and always encouraging me to my highest potential.Bojan, thank you for being an incredible teacher and always showing me patience and understanding.Earl, thank you for all the extra time you took to help me understand topics and to answer questions any day of the week.To everyone at the Hayley lab, thank you for being welcoming and inclusive when I found myself at Carleton.To my dear friends at the Schlossmacher lab, thank you for making my time in (and outside of) the lab tremendously enjoyable and memorable.I will cherish our times together for years to come.To my parents, Allan and

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même sujetParkinson's Disease Mechanisms and Treatments→Travaux en français237 207→