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Enregistrement W4206126535 · doi:10.3389/fpls.2021.774146

The CRISPR/Cas9-Mediated Modulation of SQUAMOSA PROMOTER-BINDING PROTEIN-LIKE 8 in Alfalfa Leads to Distinct Phenotypic Outcomes

2022· article· en· W4206126535 sur OpenAlexafffund
Stacy D. Singer, Kimberley Burton Hughes, Udaya Subedi, Gaganpreet Kaur Dhariwal, Kazi A. Kader, S. N. Acharya, Guanqun Chen, Abdelali Hannoufa

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Plant Science · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensUniversity of AlbertaAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaBeef Cattle Research Council
Mots-clésBiologyAlleleMutantMedicago sativaRacemeLotus japonicusPhenotypeDrought toleranceGenePerennial plantGeneticsCRISPRGenotypeInflorescenceBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Alfalfa ( Medicago sativa L.) is the most widely grown perennial leguminous forage and is an essential component of the livestock industry. Previously, the RNAi-mediated down-regulation of alfalfa SQUAMOSA PROMOTER-BINDING PROTEIN-LIKE 8 ( MsSPL8 ) was found to lead to increased branching, regrowth and biomass, as well as enhanced drought tolerance. In this study, we aimed to further characterize the function of MsSPL8 in alfalfa using CRISPR/Cas9-induced mutations in this gene. We successfully generated alfalfa genotypes with small insertions/deletions (indels) at the target site in up to three of four MsSPL8 alleles in the first generation. The efficiency of editing appeared to be tightly linked to the particular gRNA used. The resulting genotypes displayed consistent morphological alterations, even with the presence of up to two wild-type MsSPL8 alleles, including reduced leaf size and early flowering. Other phenotypic effects appeared to be dependent upon mutational dosage, with those plants with the highest number of mutated MsSPL8 alleles also exhibiting significant decreases in internode length, plant height, shoot and root biomass, and root length. Furthermore, MsSPL8 mutants displayed improvements in their ability to withstand water-deficit compared to empty vector control genotypes. Taken together, our findings suggest that allelic mutational dosage can elicit phenotypic gradients in alfalfa, and discrepancies may exist in terms of MsSPL8 function between alfalfa genotypes, growth conditions, or specific alleles. In addition, our results provide the foundation for further research exploring drought tolerance mechanisms in a forage crop.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,386
Score d'incertitude au seuil0,342

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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