MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4206199300 · doi:10.1139/cjc-2021-0229

Comparison of sample preparation methods for rare cell isolation in microfluidic devices

2022· article· en· W4206199300 sur OpenAlexvenueno aff
Jose I. Varillas, Kangfu Chen, Pablo Dopico, Jinling Zhang, Thomas J. George, Z. Hugh Fan

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Chemistry · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueMicrofluidic and Bio-sensing Technologies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Cancer Institute
Mots-clésCirculating tumor cellFicollMicrofluidicsRepeatabilityChemistryCancerBlood cancerMolecular biologyNanotechnologyOncologyCancer researchComputational biologyInternal medicineChromatographyMedicinePeripheral blood mononuclear cellBiologyMaterials scienceBiochemistryMetastasis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The analysis of circulating tumor cells (CTCs) is important for cancer diagnosis and prognosis. Microfluidics has been employed for CTC analysis due to its scaling advantages and high performance. However, pre-analytical methods for CTC sample preparation are often combined with microfluidic platforms because a large sample volume is required to detect extremely rare CTCs. Among pre-analytical methods, Ficoll-Paque™, OncoQuick™, and RosetteSep™ are commonly used to separate cells of interest. To compare their performance, we spiked L3.6pl pancreatic cancer cells into healthy blood samples and then employed each technique to prepare blood samples, followed by using a microfluidic platform to capture and detect L3.6pl cells. We found these three methods have similar performance, though the slight edge of RosetteSep™ over Ficoll-Paque™ is statistically significant. We also studied the effects of the tumor cell concentrations on the performance of the frequently used Ficoll-Paque™ method. Furthermore, we examined the repeatability and variability of each pre-analytical technique and the microfluidics-enabled detection. This study will provide researchers and clinicians with comparative data that can influence the choice of sample preparation method, help estimate CTC loss in each pre-analytical method, and correlate the results of clinical studies that employ different techniques.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,038
Score d'incertitude au seuil0,300

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCanadian Journal of ChemistryMême sujetMicrofluidic and Bio-sensing TechnologiesTravaux en français237 207