Faculty Opinions recommendation of Absence of biallelic TCRgamma deletion predicts early treatment failure in pediatric T-cell acute lymphoblastic leukemia.
Notice bibliographique
Résumé
PurposeTo identify children with T-cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL) at high risk of induction chemotherapy failure by using DNA copy number analysis of leukemic cells collected at diagnosis. Patients and MethodsArray comparative genomic hybridization (CGH) was performed on genomic DNA extracted from diagnostic lymphoblasts from 47 children with T-ALL treated on Children's Oncology Group Study P9404 or Dana-Farber Cancer Institute Protocol 00-01.These samples represented nine patients who did not achieve an initial complete remission, 13 who relapsed, and 25 who became long-term, event-free survivors.The findings were confirmed in an independent cohort of patients by quantitative DNA polymerase chain reaction (DNA-PCR), an assay that is well suited for clinical application. ResultsAnalysis of the CGH findings in patients in whom induction chemotherapy failed compared with those in whom induction chemotherapy was successful identified the absence of biallelic TCR␥ locus deletion (ABD), a characteristic of early thymocyte precursors before V(D)J recombination, as the most robust predictor of induction failure (P Ͻ .001).This feature was also associated with markedly inferior event-free (P ϭ .002)and overall survival (P Ͻ .001)rates: 25% versus 58% and 25% versus 72%, respectively.Using a rapid and inexpensive quantitative DNA-PCR assay, we validated ABD as a predictor of a poor response to induction chemotherapy in an independent series of patients. ConclusionLymphoblasts from children with T-ALL should be evaluated at diagnosis for deletion within the TCR␥ locus.Patients lacking biallelic deletion, which confers a high probability of induction failure with contemporary therapy, should be assigned to alternative therapy in the context of a prospective clinical trial.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,012 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,045 | 0,028 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».