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Enregistrement W4206256251 · doi:10.1093/jacamr/dlab197

Activity of cefepime/taniborbactam and comparators against whole genome sequenced ertapenem-non-susceptible Enterobacterales clinical isolates: CANWARD 2007–19

2021· article· en· W4206256251 sur OpenAlex
Alyssa Golden, Melanie Baxter, James A. Karlowsky, Laura Mataseje, Michael R. Mulvey, Andrew Walkty, Denice C. Bay, Frank Schweizer, Philippe Lagacé‐Wiens, Heather J. Adam, George G. Zhanel

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJAC-Antimicrobial Resistance · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensHealth Sciences CentrePublic Health Agency of CanadaUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésErtapenemCefepimeBiologyGenomeMicrobiologyCarbapenemVirologyGeneticsMeropenemGeneImipenemAntibiotic resistanceAntibiotics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Objectives This study assessed in vitro activities of cefepime/taniborbactam and comparator antimicrobial agents against ertapenem-non-susceptible Enterobacterales (ENSE) clinical isolates collected from the CANWARD study 2007–19, and associations between MIC and various mechanisms of β-lactam resistance identified using WGS. Methods A total of 179 ENSE (MIC ≥ 1 mg/L) isolates underwent susceptibility testing using reference CLSI broth microdilution. WGS was performed using the Illumina NextSeq platform. Carbapenemases, ESBLs and other β-lactamases were identified using ResFinder 4.0. Alterations in ompC/F and ftsI (PBP3) were identified by comparing extracted sequences to the appropriate NCBI reference gene. Porin alterations were analysed with Provean v1.1.3. Specific alterations of interest in PBP3 included a YRIN or YRIK insertion after P333. Results Cefepime/taniborbactam was highly active (MIC50/MIC90, 0.5/2 mg/L; 177/179 isolates inhibited at ≤ 8 mg/L) against ENSE with various antimicrobial resistance phenotypes. Thirteen (7.3%) of the 179 ENSE isolates demonstrated cefepime/taniborbactam MIC values ≥ 4 mg/L and possessed combinations of β-lactam resistance mechanisms, including a carbapenemase and/or ESBL and/or other β-lactamase genes, as well as alterations in OmpC and/or OmpF and/or PBP3. Of the two Escherichia coli isolates that demonstrated a cefepime/taniborbactam MIC of 32 mg/L, one possessed NDM-5, OXA-181 and TEM-1B, an OmpC alteration and P333_Y334insYRIN in PBP3, while the second contained CTX-M-71, a truncated OmpF and a large alteration in OmpC (F182_R195delinsMTTNGRDDVFE). Conclusions Cefepime/taniborbactam was highly active against ENSE with various antimicrobial resistance phenotypes/genotypes. ENSE isolates with cefepime/taniborbactam MIC values ≥ 4 mg/L possessed combinations of β-lactam resistance mechanisms, including β-lactamase genes, as well as alterations in OmpC and/or OmpF and/or PBP3.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,245
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle