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Enregistrement W4206355992 · doi:10.1101/2022.01.04.22268773

Timing of Breakthrough Infection Risk After Vaccination Against SARS-CoV-2

2022· preprint· en· W4206355992 sur OpenAlexafffundabout
David N. Fisman, Nelson Lee, Ashleigh R. Tuite

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensPublic Health OntarioUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesSanofiPublic Health AgencyPublic Health Agency of CanadaSeqirusAstraZenecaPfizer
Mots-clésMedicineVaccinationDosingVaccine efficacyCohortPopulationPandemicInternal medicineImmunologyCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Environmental healthDiseaseInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Provision of safe and effective vaccines has been a remarkable public health achievement during the SARS-CoV-2 pandemic. The effectiveness and durability of protection of the first two doses of SARS-CoV-2 vaccines is an important area for study, as are questions related to optimal dose combinations and dosing intervals. Methods We performed a case-cohort study to generate real-world evidence on efficacy of first and second dose of SARS-CoV-2 vaccines, using a population-based case line list and vaccination database for the province of Ontario, Canada between December 2020 and October 2021. Risk of infection after vaccination was evaluated in all laboratory-confirmed vaccinated SARS-CoV-2 cases, and a 2% sample of vaccinated controls, evaluated using survival analytic methods, including construction of Cox proportional hazards models. Vaccination status was treated as a time-varying covariate. Results First and second doses of SARS-CoV-2 vaccine markedly reduced risk of infection (first dose efficacy 68%, 95% CI 67% to 69%; second dose efficacy 88%, 95% CI 87 to 88%). In multivariable models, extended dosing intervals were associated with lowest risk of breakthrough infection (HR for redosing 0.64 (95% CI 0.61 to 0.67) at 6-8 weeks). Heterologous vaccine schedules that mixed viral vector vaccine first doses with mRNA second doses were significantly more effective than mRNA only vaccines. Risk of infection largely vanished during the time period 4-6 months after the second vaccine dose, but rose markedly thereafter. Interpretation A case-cohort design provided an efficient means to identify strong protective effects associated with SARS-CoV-2 vaccination, particularly after the second dose of vaccine. However, this effect appeared to wane once more than 6 months had elapsed since vaccination. Heterologous vaccination and extended dosing intervals improved the durability of immune response.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,065
Score d'incertitude au seuil0,130

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,055
Tête enseignante GPT0,368
Écart entre enseignants0,313 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2022
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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