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Enregistrement W4206463720 · doi:10.1139/cjss-2021-0001

Antibiotic use in commercial broiler chicken farming and its consequential resistance development in root colonizing bacteria of carrot grown in manure-applied soils in a middle-income country

2022· article· en· W4206463720 sur OpenAlexvenueno aff
W. S. Dandeniya, W. A. M. Lowe, Mathaniga Kasinthar, Rasika Jinadasa, J. K. Vidanarachchi, Thusith S. Samarakone

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Soil Science · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePharmaceutical and Antibiotic Environmental Impacts
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOxytetracyclineDaucus carotaCropBiologyManureHorticultureBroilerVeterinary medicineAnimal scienceAgronomyAntibioticsMicrobiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Broiler chicken litter (BCL) is a cheap manure for vegetable crops in developing countries. Extensive antibiotic use in poultry production could increase antibiotic resistant bacteria (ARB) in manure and eventually in crop root microbiome. We investigated the prevalence of ARB in BCL from medium- and large-scale farms (n = 33) and in carrot (Daucus carota) grown in BCL-applied soils in Sri Lanka. All the BCL samples contained aerobic bacteria resistant to 10 μg·mL−1 of oxytetracycline or enrofloxacin. The abundance of ARB determined by viable plate-count method ranged from 0.05% to 30.10% of aerobic bacterial population. Soil from two fields applied with BLC for 3 yr (short history, SH) and 10 yr (long history, LH) were treated with BCL (10%, w/w) and oxytetracycline (10 and 100 mg·kg−1) in a pot experiment alongside an unamended control. Adding BCL and oxytetracycline had a significant (P < 0.05) effect on the abundance of oxytetracycline-resistant epiphytic and endophytic bacteria (EEB) in carrot roots at harvest. Both total and oxytetracycline-resistant EEB increased significantly (P < 0.05) with the application of BCL to LH soil but not to SH soil. Carrot sold at retailed markets (n = 30) contained epiphytic bacteria resistant to 1 μg·mL−1 oxytetracycline (4.13 ± 0.207 log10CFU·g−1 dry carrot). High minimum inhibitory concentrations for oxytetracycline (≥128 μg·mL−1) were observed in 83% and 50% of ARB isolates obtained from BCL (n = 18) and carrot (n = 24), respectively. Results confirmed that BCL acts as a carrier of ARB, and continuous application of BCL to soil increased the prevalence of ARB among EEB in carrot.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,025

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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