The gut microbiome and cognitive function in midlife: The CARDIA study
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Based on experimental and clinical studies of specific patients, a gut‐brain axis has been hypothesized as mechanism connecting peripheral metabolic and immunologic activity to the brain, including cognitive functioning. Few studies have investigated the association of gut microbial composition to cognition in large community samples. Method Cross‐sectional data were from a subsample (n=597) of participants in the U.S.‐based bi‐racial Coronary Artery Risk Development in Young Adults (CARDIA) study (2015‐16). Participants were aged 48‐60 years, 45% male, and 45% Black (Table). V3‐V4 regions of 16S rRNA were sequenced from stool DNA with Illumina MiSeq technology and. microbial taxonomic measures generated from the sequenced data. After filtering out rare taxa, 107 genera (of 375 originally assigned) were included in the analysis. Participants completed six interviewer‐administered cognitive tests: Montreal Cognitive Assessment (MoCA), Digit Symbol Substitution Test (DSST), Rey‐Auditory Verbal Learning Test (RAVLT), timed Stroop test, and letter and category fluency tests. Higher scores on all tests reflect greater cognitive functioning, except for Stroop, for which faster (lower time) is better. Result Regression analysis of cognitive test scores on genera included adjustment for sequencing batch; and participant age, sex, race, BMI, and diabetes. Eleven genera were associated with two or more cognitive measures at FDR<0.10, and 31 genera were associated with two or more at FDR<0.20 (Figure): Barnesiella was positively associated with DSST and category fluency; Lachnospira was positively associated with DSST, RAVLT, MoCA, category fluency, and negatively associated with the timed Stroop test; Sutterella was negatively associated with MoCA, RAVLT, and DSST. Seven of the 11 genera with shared associations at FDR<0.10 (and 22 of the 31 at FDR<0.20) were from within the Clostridia class. Conclusion Tests of global cognition and psychomotor speed were associated with specific microbes in the gut. These microbes, particularly those stemming from Clostridia class, may be involved in short‐chain fatty acid production and inflammatory pathways. Our data contribute to a growing body of literature suggesting that the gut microbiota may relate to cognitive function. These signals must be replicated and further researched to identify relevant genetic, metabolic, and inflammatory pathways.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».