Bacterial community of reindeer lichens differs between northern and southern lichen woodlands
Notice bibliographique
Résumé
Lichens cover nearly 7% of the earth’s surface, and in eastern Canada, lichen woodlands occupy over 300 000 km 2 . Reindeer lichens (genus Cladonia) are the main component of lichen woodlands and they play a crucial role in boreal forest ecology. We study, for the first time, the bacterial community of four species of reindeer lichens from eastern North America’s boreal forests. Using the 16S rRNA gene, we characterize the bacterial community of 189 lichen samples. We aim to analyse the effect of geography and host identity in the bacterial community composition and structure, verify the presence of a common core bacteria, and identify the most abundant core taxa. Our results suggest that host-lichen identity does not determine bacterial community composition and structure in reindeer lichens, but we confirm the influence of geography in shaping the diversity and abundance of bacteria associated with Cladonia stellaris. We also reveal that reindeer lichens share a reduced common core bacteria composed exclusively by Alphaproteobacteria. Northern lichen woodlands exhibit a significantly higher diversity and abundance of bacteria associated with C. stellaris than southern lichen woodlands do. The presence of the species Methylorosula polaris in the core bacteria is evident and may have a particular importance for reindeer lichens.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».