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Enregistrement W4206521597 · doi:10.3390/ijms23010486

Interrogation of Carboxy-Terminus Localized GJA1 Variants Associated with Erythrokeratodermia Variabilis et Progressiva

2022· article· en· W4206521597 sur OpenAlexafffund
Sergiu A. Lucaciu, Qing Shao, Rhett Figliuzzi, Kevin Barr, Donglin Bai, Dale W. Laird

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Molecular Sciences · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueConnexins and lens biology
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyConnexonCell biologyMutationKeratinocyteConnexinGeneticsFrameshift mutationGeneGap junctionMolecular biologyCell cultureIntracellular

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

mutations have been shown to lead to augmented hemichannels, the consequence(s) of keratinocytes harboring a de novo P283L variant alone or in combination with a de novo T290N variant remain unknown. Interestingly, these variants reside within or adjacent to a carboxy terminus polypeptide motif that has been shown to be important in regulating the internalization and degradation of Cx43. Cx43-rich rat epidermal keratinocytes (REKs) or Cx43-ablated REKs engineered to express fluorescent protein-tagged P283L and/or T290N variants formed prototypical gap junctions at cell-cell interfaces similar to wildtype Cx43. Dye coupling and dye uptake studies further revealed that each variant or a combination of both variants formed functional gap junction channels, with no evidence of augmented hemichannel function or induction of cell death. Tracking the fate of EKVP-associated variants in the presence of the protein secretion blocker brefeldin A, or an inhibitor of protein synthesis cycloheximide, revealed that P283L or the combination of P283L and T290N variants either significantly extended Cx43 residency on the cell surface of keratinocytes or delayed its degradation. However, caution is needed in concluding that this modest change in the Cx43 life cycle is sufficient to cause EKVP, or whether an additional underlying mechanism or another unidentified gene mutation is contributing to the pathogenesis found in patients. This question will be resolved if further patients are identified where whole exome sequencing reveals a Cx43 P283L variant alone or, in combination with a T290N variant, co-segregates with EKVP across several family generations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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