Mass spectrometric measurement of six site‐specific tau phosphorylations in CSF and blood of Alzheimer's disease patients
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Hyperphosphorylation of tau is responsible for its loss of normal physiological function, gain of toxicity and its aggregation to form NFTs. Increased phosphorylated tau is detected in Alzheimer´s disease (AD) CSF and blood, and changes in the tau phosphorylation pattern may reflect different stages of the disease progression. A better understanding on how the levels of site‐specific phosphorylations are modulated across the AD continuum in these biofluids may help to provide with a more accurate diagnosis. Method We developed an LC‐MS method based on parallel reaction monitoring (PRM) using Orbitrap MS to measure tau phosphorylations at positions pT181, pS199, pT205, pT217 and pT231 in CSF and plasma, and additionally p396 in CSF. Tau enrichment prior to LC‐MS differed between biofluids. For CSF, 250 µl of sample were prepared by performing partial PCA protein precipitation, followed by SPE and tryptic digestion. For plasma, 1 ml samples were subjected to immunoprecipitation using a combination of several tau antibodies, followed by tryptic digestion and SPE. Result The performance of the method was first evaluated by analysis of CSF from neurochemically characterized AD patients and controls (n=40). All measured phosphorylations showed significant separation between groups (p<0.001) (Fig. 1). In addition, pT181, pT217 and pT231 showed good correlations with SIMOA immunoassays. In plasma, a set of AD patients and controls (n=26) were analysed. All phosphorylations showed an increase in AD, and most significantly pT205 (p=0.003) and pT231 (p=0.008) (Fig 2). Interestingly, these two phosphorylations were the ones that showed higher correlation with p‐tau CSF (Spearman r=0.52 and r=0.63, respectively). Plasma values were also compared to the respective SIMOA immunoassays. Finally, the method was used to measure samples from the Translational biomarker In Aging and Dementia (TRIAD) cohort (n=209), consisting of young individuals (<30 years old), cognitive unimpaired, mild cognitive impairment (MCI) and AD patients. Conclusion With our LC‐MS method to quantify site‐specific p‐tau levels, we have established the tau phosphorylation pattern in AD biofluids. Our data indicates that phosphorylation at position T231 is the one that shows a higher fold change between AD and controls both in CSF and blood.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».