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Enregistrement W4206559384 · doi:10.1101/2022.01.02.474499

Genetically-linked simultaneous overexpression of multiple herbicide-metabolizing genes for broad-spectrum resistance in an agricultural weed <i>Echinochloa phyllopogon</i>

2022· preprint· en· W4206559384 sur OpenAlexfundno aff
Hiroe Suda, T. Kubo, Yusuke Yoshimoto, Keisuke Tanaka, Satoru Tanaka, Akira Uchino, Satoshi Azuma, Makoto Hattori, Takuya Yamaguchi, Masahiro Miyashita, Tohru Tominaga, Satoshi Iwakami

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWeed Control and Herbicide Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsNODAI Genome Research Center, Tokyo University of AgricultureJapan Society for the Promotion of ScienceTokyo University of AgricultureMinistry of Education, Culture, Sports, Science and Technology
Mots-clésGeneBiologyGeneticsPopulationCytochrome P450Gene expressionMetabolismBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary Previous research unveiled that the overexpression of catalytically promiscuous CYP81A cytochrome P450s underlies the multiple-herbicide resistance (MHR) in a Californian population of Echinochloa phyllopogon . However, it does not fully accommodate the resistance to diverse herbicides in MHR E. phyllopogon although the genetic inheritance of MHR was suggested as under a single gene control. We investigated the high-level resistance to diclofop-methyl in MHR E. phyllopogon . Detailed diclofop-methyl metabolism was analyzed, followed by gene expression study and functional characterization of P450 genes. The generality of the MHR mechanism was investigated using another MHR line. The MHR line rapidly produced two distinct hydroxylated-diclofop-acid, only one of which was the major metabolite produced by CYP81A12/21. Gene expression study identified the genetically linked overexpression of a novel gene CYP709C69 with CYP81A12/21 in the MHR line. The gene conferred diclofop-methyl resistance in plants and produced another hydroxylated-diclofop-acid in yeast. The activity was observed in some CYP709C in plants. Unlike the broad substrate-specificity in CYP81As, CYP709C69 showed narrow substrate-specificity. The overexpression of the CYP81A and CYP709C69 was also observed in another MHR line. The present findings establish a novel concept that genetically-linked simultaneous overexpression of herbicide-metabolizing genes enhances and broadens the profile of metabolic resistance in weeds.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,725
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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