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Enregistrement W4206559440 · doi:10.1101/2022.01.04.22268771

Detection of fecal coliforms and SARS-CoV-2 RNA in sewage and recreational waters in the Ecuadorian Coast: a call for improving water quality regulation

2022· preprint· en· W4206559440 sur OpenAlexaff
Maritza Cárdenas-Calle, Leandro Patiño, Beatriz Pernía, Roberto Erazo, Carlos Muñoz, Magaly Valencia-Avellan, Mariana Lozada, Mary Regato-Arrata, Miguel Ángel Rodríguez Barrera, Segundo Aquino, Stalyn Moyano, Stefania Fuentes, Francisco Javier Duque, Luis Velázquez-Araque, Bertha Carpio, Carlos Méndez-Roman, Carlos I. Calle, Guillermo Cárdenas, David Guizado-Herrera, Clara Lucía Tello, Verónica Bravo-Basantes, Josué Zambranod, Jhannelle Francis, Miguel Uyaguari

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 detection and testing
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesFP7 International CooperationDeutsche Gesellschaft für Internationale ZusammenarbeitSecretaría de Educación Superior, Ciencia, Tecnología e InnovaciónMinisterio del Ambiente, Agua y Transición Ecológica
Mots-clésFecal coliformSewageEstuaryWater qualityWastewaterEnvironmental scienceSalinityPollutionFecesContaminationSeawaterWater pollutionSewage treatmentBiologyVeterinary medicineEnvironmental engineeringFisheryEcologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Wastewater surveillance represents an alternative approach for the diagnosis and early detection of infectious agents of public health importance. This study aimed to evaluate SARS-CoV-2 and other quality markers in oxidation lagoons, estuarine areas and seawater at Guayas and Santa Elena in Ecuador. Sample collections were conducted twice at 42 coastal sites and 2 oxidation lagoons during dry and rainy seasons (2020-2021). Physico-chemical and microbiological parameters were evaluated to determine organic pollution. Quantitative reverse transcription PCR was conducted to detect SARS-CoV-2. Results showed high levels of Escherichia coli and low dissolved oxygen concentrations. SARS-CoV-2 was detected in sea-waters and estuaries with salinity levels between 34.2-36.4 PSU and 28.8 °C-31.3 °C. High amounts of fecal coliforms were detected and correlated with the SARS-CoV-2 shedding. We recommend to decentralized autonomous governments in developing countries such as Ecuador to implement corrective actions and establish medium-term mechanisms to minimize a potential contamination route. HIGHLIGHTS SARS-CoV-2 RNA was detected in estuaries, bays and the wastewater treatment systems in Playas and Santa Elena. High levels of fecal coliforms were detected along shorelines. Water quality parameters revealed a negative impact on the beaches studied associated with human activities.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,176
Score d'incertitude au seuil0,532

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,057
Tête enseignante GPT0,328
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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