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Enregistrement W4206580096 · doi:10.1111/syen.12533

Anchored phylogenomics and a revised classification of the planidial larva clade of jewel wasps (Hymenoptera: Chalcidoidea)

2022· article· en· W4206580096 sur OpenAlexaff
Junxia Zhang, John M. Heraty, Christopher Darling, Robert L. Kresslein, Austin Baker, Javier Torréns, Jean–Yves Rasplus, Alan R. Lemmon, Emily Moriarty Lemmon

Notice bibliographique

RevueSystematic Entomology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueFossil Insects in Amber
Établissements canadiensRoyal Ontario MuseumUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Science Foundation of Sri Lanka
Mots-clésBiologyCladeIncertae sedisParaphylyMonophylyZoologySister groupGenusHost (biology)Phylogenetic treeEvolutionary biologyEcologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Planidia are free‐living, mobile first‐instar larvae that are notable in their ability to transition across different larval stages of their host, and for completing their development on the host prepupa as ectoparasitoids, effectively acting as larval‐pupal external koinobionts. Chalcidoid taxa with a planidium form a monophyletic group, the planidial larva clade (PLC). We conducted a phylogenomic study of the PLC using anchored hybrid enrichment data. Phylogenetic analyses support the backbone relationship of PLC as: (Eutrichosomatinae, ((Philomidinae, Chrysolampinae), (Perilampinae, Eucharitidae))). Although excluded from the main analyses, the genus Jambiya , based on only 11 loci recovered, was placed as the sister of Chrysolampinae + Philomidinae or Perilampinae + Eucharitidae. Our results demonstrate that Perilampidae (Philomidinae, Chrysolampinae and Perilampinae) are paraphyletic. Divergence dating based on four node calibrations based on fossils suggests that the PLC arose approximately 111 Ma and the evolution of ant parasitism at least 64 Ma. Host associations, direct versus indirect hyperparasitism, ability to attack a host within a cocoon, soft versus hard planidial forms and mobility of the planidium were explored using a likelihood‐based ancestral state reconstruction method. A revised higher‐level classification of the PLC is proposed, with Eutrichosomatinae elevated to Eutrichosomatidae ( stat. rev. ), Chrysolampinae and Philomidinae placed in Chrysolampidae ( stat. rev. ), Perilampidae ( stat. rev. ) restricted to what was referred to as Perilampinae, and Eucharitidae maintained with four subfamilies, with Akapalinae (unknown biology) as sister group to the core Eucharitidae, all of which are ant parasitoids. Jambiya is treated as an incertae sedis taxon within the planidial clade.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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