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Enregistrement W4206593728 · doi:10.1073/pnas.2115860119

Balancing openness with Indigenous data sovereignty: An opportunity to leave no one behind in the journey to sequence all of life

2022· article· en· W4206593728 sur OpenAlexfundno aff
Ann M. Mc Cartney, Jane Anderson, Libby Liggins, Māui Hudson, Matthew Z. Anderson, Ben TeAika, Janis Geary, Robert Cook‐Deegan, Hardip R. Patel, Adam M. Phillippy

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEnvironmental DNA in Biodiversity Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Cancer InstituteNational Human Genome Research InstituteUniversity of California, DavisUniversity of Illinois at Urbana-ChampaignNational Science FoundationRoyal SocietyCanadian Institutes of Health ResearchMinistry of Business, Innovation and EmploymentMassey UniversityNational Endowment for the HumanitiesYork UniversityUniversity of WaikatoNational Institutes of Health
Mots-clésOpenness to experienceIndigenousData sharingConvention on Biological DiversityEquity (law)GenomicsStandardizationOpen sciencePublic relationsMetagenomicsPolitical scienceBiodiversityBiologyEcologyLawGeneticsMedicinePsychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The field of genomics has benefited greatly from its "openness" approach to data sharing. However, with the increasing volume of sequence information being created and stored and the growing number of international genomics efforts, the equity of openness is under question. The United Nations Convention of Biodiversity aims to develop and adopt a standard policy on access and benefit-sharing for sequence information across signatory parties. This standardization will have profound implications on genomics research, requiring a new definition of open data sharing. The redefinition of openness is not unwarranted, as its limitations have unintentionally introduced barriers of engagement to some, including Indigenous Peoples. This commentary provides an insight into the key challenges of openness faced by the researchers who aspire to protect and conserve global biodiversity, including Indigenous flora and fauna, and presents immediate, practical solutions that, if implemented, will equip the genomics community with both the diversity and inclusivity required to respectfully protect global biodiversity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,086
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,092
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesScience ouverte
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,996
Score d'incertitude au seuil0,455

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0860,092
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0150,082
Communication savante0,0170,037
Science ouverte0,0040,020
Intégrité de la recherche0,0170,030
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,174
Tête enseignante GPT0,317
Écart entre enseignants0,142 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations86
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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