Faculty Opinions recommendation of A SUMOylation-dependent pathway mediates transrepression of inflammatory response genes by PPAR-gamma.
Notice bibliographique
Résumé
Peroxisome proliferator-activated receptor-gamma (PPAR-gamma) has essential roles in adipogenesis and glucose homeostasis, and is a molecular target of insulin-sensitizing drugs. Although the ability of PPAR-gamma agonists to antagonize inflammatory responses by transrepression of nuclear factor kappa B (NF-kappaB) target genes is linked to antidiabetic and antiatherogenic actions, the mechanisms remain poorly understood. Here we report the identification of a molecular pathway by which PPAR-gamma represses the transcriptional activation of inflammatory response genes in mouse macrophages. The initial step of this pathway involves ligand-dependent SUMOylation of the PPAR-gamma ligand-binding domain, which targets PPAR-gamma to nuclear receptor corepressor (NCoR)-histone deacetylase-3 (HDAC3) complexes on inflammatory gene promoters. This in turn prevents recruitment of the ubiquitylation/19S proteosome machinery that normally mediates the signal-dependent removal of corepressor complexes required for gene activation. As a result, NCoR complexes are not cleared from the promoter and target genes are maintained in a repressed state. This mechanism provides an explanation for how an agonist-bound nuclear receptor can be converted from an activator of transcription to a promoter-specific repressor of NF-kappaB target genes that regulate immunity and homeostasis. PMID: 16127449 Funding information This work was supported by: NIDDK NIH HHS, United States Grant ID: R37 DK039949 NIDDK NIH HHS, United States Grant ID: R01 DK091183 NCI NIH HHS, United States Grant ID: R01 CA052599
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,003 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,493 | 0,250 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».