Faculty Opinions recommendation of Complete chemical structures of human mitochondrial tRNAs.
Notice bibliographique
Résumé
Mitochondria generate most cellular energy via oxidative phosphorylation.Twenty-two species of mitochondrial (mt-)tRNAs encoded in mtDNA translate essential subunits of the respiratory chain complexes.mt-tRNAs contain post-transcriptional modifications introduced by nuclear-encoded tRNA-modifying enzymes.They are required for deciphering genetic code accurately, as well as stabilizing tRNA.Loss of tRNA modifications frequently results in severe pathological consequences.Here, we perform a comprehensive analysis of posttranscriptional modifications of all human mt-tRNAs, including 14 previously-uncharacterized species.In total, we find 18 kinds of RNA modifications at 137 positions (8.7% in 1575 nucleobases) in 22 species of human mt-tRNAs.An up-to-date list of 34 genes responsible for mt-tRNA modifications are provided.We identify two genes required for queuosine (Q) formation in mt-tRNAs.Our results provide insight into the molecular mechanisms underlying the decoding system and could help to elucidate the molecular pathogenesis of human mitochondrial diseases caused by aberrant tRNA modifications.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,009 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,005 | 0,009 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,102 | 0,120 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».