Canadian Public Health Laboratory Network Best Practices for COVID-19
Notice bibliographique
Résumé
The ability to detect severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), the causative agent of COVID-19, is a foundational component of Canada's containment and mitigation strategies. Laboratory confirmation of COVID-19 cases allows the appropriate clinical management and public health interventions. Whether the local goal is containment or mitigation will depend on local epidemiology of the pandemic. The Respiratory Virus Infections Working Group of the Canadian Public Health Laboratory Network has developed comprehensive Best Practice Guidelines for detection of SARS-CoV-2. Best practices for specimen collection, transportation, testing and biosafety are addressed from the perspective of Canadian public health laboratories to ensure a consistent approach across the country: Population-based testing for COVID-19 should initially be carried out for surveillanceNasopharyngeal swab is the specimen of choice for routine testingNucleic acid amplification tests (such as real-time reverse transcription polymerase chain reaction) are the method of choice for routine testing of SARS-CoV-2The decentralization of nucleic acid amplification testing for COVID-19 to hospital or other high complexity medical laboratories should be promoted to increase test capacity and meet increased demandsIn the early stages of the pandemic, positive (approximately 10-20) and negative (approximately 50) tests by a provincial laboratory require confirmation at the National Microbiology LaboratoryCo-circulation of other viral agents associated with influenza-like Illnesses (e.g. influenza A and B and respiratory syncytial virus) should be monitored as capacity permits, as part of ongoing surveillanceOnce validated, serological testing may be utilized for assessing the presence/absence of immune response to the SARS-CoV-2 at either the population or individual level for select indications, but is likely to be of limited utility in diagnosis of acute COVID-19 illness These recommendations will be updated as new information becomes available.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,231 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».