The <scp>bHLH</scp> family <scp>NITROGEN‐REPLETION INSENSITIVE1</scp> represses nitrogen starvation‐induced responses in <i>Chlamydomonas reinhardtii</i>
Notice bibliographique
Résumé
SUMMARY The use of nitrogen (N) fertilizers has contributed to a quadrupling of agricultural production. However, >50% of N fertilizers remain unabsorbed by crops and leak into the environment, demanding strategies to improve N use efficiency. To identify the regulatory mechanisms of N assimilation, we performed a genetic screen using a Chlamydomonas reinhardtii strain whose motility depends upon the transcription of nitrate reductase‐encoding NIT1 , which is upregulated in response to N starvation. A constantly swimming mutant, nitrogen repletion insensitive 1 ( nri1 ), was isolated and found to express N starvation‐induced genes in N‐replete culture. NRI1 , previously reported as NSG17 ( nitrogen starvation‐induced gene 17 ), encodes a basic helix–loop–helix (bHLH) family transcription factor homologous to BES‐interacting myc ‐like (BIM) in plants. Transcriptome analysis of N‐replete nri1 culture revealed a concerted upregulation of the genes involved in the uptake and assimilation of external N sources. Many transcription factor‐encoding genes in the bHLH and SBP families were also upregulated in nri1 culture. The DNA‐binding sites of bHLH and SBP proteins were enriched in the promoters of the upregulated genes in nri1 , suggesting that NRI1 suppresses transcriptional activators to regulate N starvation‐induced genes. Consistent with the ammonium‐insensitive gene expression pattern, N‐starved nri1 gametes could not dedifferentiate back to vegetative cells when incubated in ammonium‐containing media. Taken together, we conclude that NRI1 represses N starvation‐specific responses when sufficient N is supplied in C. reinhardtii . Further investigation of how cellular N conditions regulate NRI1 activity will unravel the elusive mechanisms by which plant cells sense and respond to N starvation.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».