Tool and chemical probe development for emerging targets in Alzheimer’s disease: The Emory‐Sage‐SGC TREAT‐AD Center
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Alzheimer’s disease (AD) is the most common form of dementia, with no effective preventative strategies or treatments. The drug development pipeline in AD has been marked by repeated failures to find an effective treatment. Increasing evidence supports the need for greater pipeline target diversity and new approaches to target the disease. The Emory‐Sage‐SGC TREAT‐AD Center (https://treatad.org) was established to forge a new path forward with the aim of developing drugs for emerging targets in AD beyond the two pathological hallmarks. By casting a wider net, we aim to develop tools and chemical probes that target the multifaceted dysregulation in the brains of AD patients, and expand the portfolio of therapeutic approaches to break the cycle of failure. We believe that this more‐inclusive perspective will enrich the AD field and advance the discovery of potential drug targets for AD. Method The Emory‐Sage‐SGC TREAT‐AD Center has selected a diverse set of novel AD targets derived from systems biology studies within the Accelerating Medicines Partnership in AD (AMP‐AD) consortium and further evaluated using data from multiple AD consortia and existing literature. Targets nominated through the AMP‐AD consortium were scored based on unbiased bioinformatic assessments across multiple lines of evidence including genetic, multi‐omic, neuropathological, and literature‐based metrics and were mapped to mechanistic hypotheses residing in distinct biological domains that are altered in AD. Target Enabling Packages, including expression constructs, knockout cell lines, assays, antibodies and crystal structures, are being generated for 20 proteins prioritized using this approach. Hit characterization and chemical probe development has started for targets in which the evidence for AD biology is strong. All data and reagents will be publicly shared through standard repositories and cataloged at the Agora site (https://agora.adknowledgeportal.org). Result The Emory‐Sage‐SGC Center goals are: to identify and prioritize novel emerging targets for AD; to generate reagents and tools for emerging targets to encourage the community to expand the pipeline of potential AD therapeutic targets; and to share all data, tools, and reagents openly, rapidly, and without restriction. Conclusion All data, protocols, reagent sets, and chemical tools and will be made widely available. For more information see www.treatad.org.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,015 | 0,008 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,004 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,004 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,016 | 0,012 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».