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Enregistrement W4206791375 · doi:10.22215/etd/2021-14810

Methyl Epigenetic Mechanisms in the Freeze-Tolerance Response of Rana Sylvatica Nervous Tissue

2021· dissertation· en· W4206791375 sur OpenAlexaff
Tighe Bloskie

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typedissertation
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensCarleton UniversityWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEpigeneticsBiologyHistoneDNA methylationEpigenetic regulation of neurogenesisTranscription factorGene expressionTranscription (linguistics)Transcriptional regulationMethylationCell biologyGeneGeneticsHistone methyltransferase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Wood frog freeze tolerance is a classic example of metabolic rate depression (MRD), which facilitates reprioritization of minimal anaerobic resources to pro-survival pathways.Global gene expression is consequentially suppressed due, in part, to transcriptional controls, but to date, specific mechanisms have received little attention.Methylation of DNA and histone lysine residues are common epigenetic mechanisms that are tightly associated with control of transcription and thus have been implicated in MRD.However, preliminary findings appeared tissue-and species-specific, and considering research into nervous tissues was lacking, further investigation is required.This thesis tracks the expression and activity of some key methyl epigenetic modifiers like lysine/DNA methyltransferases and DNA demethylases, as well as selected putative targets across the wood frog freeze-thaw cycle and associated sub-stresses.This thesis provides strong evidence in favour of roles for H3K9 and DNA hypomethylation during freeze recovery, which are largely correlated with changes in expression of catalyzing enzymes.Some non-histone target roles are also suggested.Alleviation of repressive epigenetic controls likely contribute to the resumption of a permissive transcriptional state and may induce the activity of essential repair pathways during thawing.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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