A Machine Learning Analysis of Health Records of Patients With Chronic Kidney Disease at Risk of Cardiovascular Disease
Notice bibliographique
Résumé
Chronic kidney disease (CKD) describes a long-term decline in kidney function and has many causes. It affects hundreds of millions of people worldwide every year. It can have a strong negative impact on patients, especially when combined with cardiovascular disease (CVD): patients with both conditions have lower survival chances. In this context, computational intelligence applied to electronic health records can provide insights to physicians that can help them make better decisions about prognoses or therapies. In this study we applied machine learning to medical records of patients with CKD and CVD. First, we predicted if patients develop severe CKD, both including and excluding information about the year it occurred or date of the last visit. Our methods achieved top mean Matthews correlation coefficient (MCC) of +0.499 in the former case and a mean MCC of +0.469 in the latter case. Then, we performed a feature ranking analysis to understand which clinical factors are most important: age, eGFR, and creatinine when the temporal component is absent; hypertension, smoking, and diabetes when the year is present. We then compared our results with the current scientific literature, and discussed the different results obtained when the time feature is excluded or included. Our results show that our computational intelligence approach can provide insights about diagnosis and and relative important of different clinical variables that otherwise would be impossible to observe.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,016 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,005 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».