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Enregistrement W4206944447 · doi:10.1002/gcc.23025

Advances in sarcoma molecular diagnostics

2022· review· en· W4206944447 sur OpenAlexafffund
Xue Q. Wang, Angela Goytain, Brendan C. Dickson, Torsten O. Nielsen

Notice bibliographique

RevueGenes Chromosomes and Cancer · 2022
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSarcoma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity of TorontoMount Sinai HospitalCentre for Advancing Health OutcomesUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesTerry Fox Research InstituteCanadian Cancer Society
Mots-clésComputational biologyMolecular diagnosticsBiologyFluorescence in situ hybridizationPolymerase chain reactionDNA sequencingBioinformaticsGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sarcomas are cancers of mesenchymal origin with the potential to arise in diverse anatomic locations. With over 80 subtypes, which often demonstrate overlapping morphologies, sarcomas frequently require ancillary testing to enable accurate classification. Pathognomonic driver mutations can often be leveraged for diagnostic purposes and include fusion genes, amplification events, and recurrent point mutations. Until relatively recently, the major clinical molecular diagnostic tests have been karyotyping, fluorescence in situ hybridization, and polymerase chain reaction; however, these techniques have a number of limitations. Recent technological advances have led to the development of more comprehensive assays with higher throughput, thereby replacing the need for a suite of single gene tests. These approaches include next-generation sequencing, fluorescent bar code hybridization, and DNA methylation profiling, among others. Herein, we review the application of recently developed techniques relevant to the diagnosis of sarcomas, and emerging assays with the potential for future development and clinical implementation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,992
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,351
Écart entre enseignants0,315 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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